科技创新和学科建设是高校发展建设的命脉，是我院建设世界一流医学院的核心。21世纪是生命科学的世纪，以生命学科为基础的医学面临着新的发展机遇。“十二五”期间，医学院将进一步聚焦国家中长期科技发展规划，面向国家和上海市的经济与社会发展需求，瞄准医学科技发展前沿，加强学科建设和科学研究，统筹协调基础学科、临床与应用学科以及新兴学科的发展。坚持有所为，有所不为，着力推动学科交叉、渗透与融合，提升学科核心竞争实力。构建科技创新和转化平台，鼓励自主科技创新，促进重大科技项目的联合申报与研究，加强国际合作，力争产出更多具有国际影响的科研成果。
瞄准国家科技和教育发展战略，对接上海卫生事业改革与发展重大需求，以科技创新为宗旨，以国际医学前沿和影响我国国民健康的恶性肿瘤、心脑血管疾病、糖尿病等重大疾病为目标，以国家科技创新平台和重大基础设施建设为抓手，强化转化医学的理念，进一步整合优势资源，完善科技竞争和激励机制，改进科技工作环境，营造良好的学术氛围，推进国际科技合作与交流，全面提升参与国家重大医学及生命科学规划和研究的能力，提高科研项目和研究成果的质量，力争科技创新取得新突破，一流医学院建设取得新进展。
“十二五”期间，医学院将按照国家生命科学和医学发展战略，依托新一轮“211”工程、“985”、“085”等国家地方重大项目和科技基础设施的建设，吸引和培养优秀科技人才，加大资源的优化与整合，组建大团队，构造大平台，争取大项目，产生大成果，力争科研经费总量突破20亿元，国家自然基金项目累计1100项，新增国家杰出青年6-8人，重大重点项目20项，科技论文（包括SCI论文）由单纯追求数量增长向数量与质量并重方向转变，国家重大科研成果奖励取得新突破，科技创新能力进一步提高，医学和生命科学领域重大项目的竞争优势更加明显，科技整体水平名列国内医学院校前茅。
