浦西校区：

动科部5楼B区屏障为小鼠核心保种区；6楼B区繁殖屏障、4楼A区屏障、5楼A区屏障、6楼A区屏障为小鼠繁殖保种区；6楼B区实验屏障、2楼B区屏障、1楼B区屏障为大小鼠实验区；动科部另设有小鼠隔离器（保种）、小鼠隔离器（隔离检疫）、行为学实验室及大动物区。各类屏障区域按微生物清洁等级划分由高到低依次为小鼠核心保种区、小鼠繁殖保种区、小鼠隔离器（保种）、大小鼠实验区、行为学实验室、大动物区、小鼠隔离器（隔离检疫）。当日进出动科部的人员如需进入一个以上动物饲养区域，必须先进入清洁等级更高的饲养区域，后进入低清洁等级的饲养区域。

浦东校区：

动科部4楼屏障为小鼠核心保种区；2楼和3楼为大小鼠实验区；B1层A区为仪器设备检测和实验区，动科部另设有小鼠隔离器（保种）、小鼠隔离器（隔离检疫）、行为学实验室及大动物区。各类屏障区域按微生物清洁等级划分由高到低依次为小鼠核心保种区、小鼠繁殖保种区、小鼠隔离器（保种）、大小鼠实验区、行为学实验室、大动物区、小鼠隔离器（隔离检疫）。当日进出动科部的人员如需进入一个以上动物饲养区域，必须先进入清洁等级更高的饲养区域，后进入低清洁等级的饲养区域。