程曦

基本信息 >>>

程曦

人工智能糖类药物设计研究组

邮箱：xichengeva@sjtu.edu.cn

研究方向 >>>

（1）人工智能与分子模拟算法开发；

（2）计算驱动的糖结构与功能研究；

（3）靶向糖调控的新型药物研发。

个人简历 >>>

程曦，研究员，博士生导师

人工智能糖类药物设计课题组长

上海市东方英才青年科技平台优秀学术带头人

中国科学院青年创新促进会优秀会员

2006.9-2010.6 华中科技大学，学士

2010.8-2015.5 堪萨斯大学计算生物学中心，博士

2015.9-2017.9 中国科学院上海药物研究所，博士后

2017.10-2021.9 中国科学院上海药物研究所，副研究员

2021.10-2025.4 中国科学院上海药物研究所，研究员

2025.5-至今 上海交通大学医学院，研究员，课题组长

科研项目 >>>

1.    上海市东方英才计划，QNKJ2024005，基于人工智能与分子模拟的糖机制解析，2025年1月-2027年12月，40万元，项目负责人

2.    中国科学院青年创新促进会基金，Y2022077，基于动态构象的膜受体靶标机制研究及靶向药物设计，2023年1月-2025年12月，200万元，项目负责人

3.    国家自然科学基金委员会青年项目，31800635，β2肾上腺素受体的选择性G蛋白偶联机制研究，2019年1月-2021年12月，25万元 ，项目负责人

代表论文 >>>

1.    Qinyu Chu#, Xinheng He#, Xinyi Tan#, Zhiyong Gu, Yin Luo, Zifu Huang, Mingyue Zheng*, Xi Cheng*. GlycanInsight: an open platform for carbohydrate-binding pocket prediction and characterization. Chemical Science 2025, 16(23):10264-10272 

2.    Xuewu Zhu#, Meixuan Ping#, Heng Liu#, Ting Yu#, Zhongwen Jiang#, Zhenhua Liu#, Chanjing Li#, Xinjiao Hou#, Qinyu Chu, Shuyao Li, Caiwen Mao, Ting Luo, Chunlan Kang, Feng Wang, Chuanyan Yang, Meiqin Tang, Zhidong Jiang, Zhaobing Gao, Hong Liu, H. Eric Xu, Beisha Tang*, Xi Cheng*, Wanchao Yin*, Yu Zhou*, Ping Li*. Structural insights into the activation of TMEM175 by small molecule. Neuron 2025.

3.    Xinheng He#, Lifen Zhao#, Yinping Tian#, Rui Li, Qinyu Chu, Zhiyong Gu, Mingyue Zheng, Yusong Wang, Shaoning Li, Hualiang Jiang, Yi Jiang, Liuqing Wen*, Dingyan Wang*, Xi Cheng*. Highly accurate carbohydrate-binding site prediction with DeepGlycanSite. Nature Communications 2024, 15(1):5163

4.    Guangda Yao#, Yinping Tian#, Wenjun Ke#, Jie Fang, Shengzhou Ma, Tiehai Li, Xi Cheng*, Bingqing Xia*, Liuqing Wen*, Zhaobing Gao*. Direct identification of complex glycans via a highly sensitive engineered nanopore. Journal of the American Chemical Society 2024, 146(19):13356-13366

5.    Bingqing Xia#*, Jie Fang#, Shengzhou Ma#, Mengyao Ma#, Guangda Yao, Tiehai Li, Xi Cheng*, Liuqing Wen*, Zhaobing Gao*. Mapping the acetylamino and carboxyl groups on glycans by engineered α-hemolysin nanopores. Journal of the American Chemical Society 2023, 145(34): 18812-18824

6.    Lifen Zhao, Fangyu Wei, Xinheng He, Antao Dai, Dehua Yang, Hualiang Jiang, Liuqing Wen*, Xi Cheng*. Identification of a carbohydrate-recognition motif of purinergic receptors. eLife 2023, 12:e85449

7.    Jia Duan#, Peiyu Xu#, Xi Cheng#, Chunyou Mao#, Tristan Croll, Xinheng He, Jingjing Shi, Xiaodong Luan, Wanchao Yin, Erli You, Qiufeng Liu, Shuyang Zhang, Hualiang Jiang, Yan Zhang*, Yi Jiang*, H Eric Xu*. Structures of full-length glycoprotein hormone receptor signalling complexes. Nature 2021, 598(7882):688-692 

8.    Peiyu Xu#, Sijie Huang#, Chunyou Mao#, Brian E Krumm#, Edward Zhou, Yangxia Tan, Xi-Ping Huang, Yongfeng Liu, Dan-Dan Shen, Yi Jiang, Xuekui Yu, Hualiang Jiang, Karsten Melcher, Bryan Roth*, Xi Cheng*, Yan Zhang*, H Eric Xu*. Structures of the human dopamine D3 receptor-Gi complexes. Molecular Cell 2021, 81(6):1147-1159

9.    Peiyu Xu#, Sijie Huang#, Huibing Zhang#, Chunyou Mao#, Edward Zhou#, Xi Cheng#, Icaro A Simon, Dan-Dan Shen, Hsin-Yung Yen, Carol V Robinson, Kasper Harps?e, Bo Svensson, Jia Guo, Hualiang Jiang, David Gloriam, Karsten Melcher, Yi Jiang*, Yan Zhang*, H Eric Xu*. Structural insights into the lipid and ligand regulation of serotonin receptor. Nature 2021, 592(7854):469-473

10.    Zhaotong Cong#, Fulai Zhou#, Chao Zhang#, Xinyu Zou#, Huibing Zhang, Yuzhe Wang, Qingtong Zhou, Xiaoqing Cai, Qiaofeng Liu, Jie Li, Lijun Shao, Chunyou Mao, Xi Wang, Jihong Wu, Tian Xia, Li-Hua Zhao, Hualiang Jiang, Yan Zhang, H Eric Xu, Xi Cheng*, Dehua Yang*, Ming-Wei Wang*. Constitutive signal bias mediated by the human GHRHR splice variant 1. Proceedings of the National Academy of Sciences 2021, 118(40):e2106606118

荣誉与奖励 >>>

2025 全国大学生职业规划大赛全国总决赛优秀指导教师奖

2024上海市东方英才青年科技平台优秀学术带头人

2024“天河之星”年度优秀应用奖

2022中国科学院青年创新促进会优秀会员