师资队伍
庄友文
  作者:庄友文  2020-12-15



 

庄友文
分子药理和药物设计研究组

电话:021-63846590-776452
邮箱:youwen_zhuang@sjtu.edu.cn

 

研究方向:

课题组致力于G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)分子药理学和药物设计研究。聚焦神经递质GPCR,包括多巴胺、阿片和血清素受体系统等。

研究方向包括:

1. 阐明GPCR精准药理学和信号转导机制的分子基础。GPCR对多种具有不同药理学特征的配体产生反应,例如拮抗、部分激动和变构调节剂活性等。我们旨在揭示这些不同药理反应背后的精确分子机制,从而为设计具有所需药理活性的药物提供创新思路和理论依据;

2. “结构+人工智能”双驱动的靶向神经系统疾病新药筛选、设计和开发;

3. 神经精神类药物的神经药理机制研究;

4. 神经系统疾病创新药物靶点鉴定和发现。

 

个人简历

庄友文,上海交通大学医学院研究员、博导。研究方向为G蛋白偶联受体分子药理和药物设计,聚焦神经递质受体领域。目前以通讯/第一作者(含共同)在Cell4)、NeuronNat Chem Biol2)和PNAS等发表十余篇研究论文,成果分别入选Cell封面和年度最佳论文。对阿片受体和多巴胺受体家族开展了较为深入的精准药理和信号传导新机制探索,并取得系列创新发现,为疼痛和精神分裂症等神经系统疾病靶向治疗提供了新见解。已获国家重点研发计划、国家自然科学基金委和上海市科委等基金项目资助,入选中国科协青年人才托举工程和中国科学院青年创新促进会等;获《MIT Technology Review》“TR35”中国、中国新锐科技人物突出成就奖、上海市科技青年35人引领计划(“35U35”)、上海市自然科学一等奖(第五)、中国药学会科学技术奖一等奖(第六)和赛诺菲优秀青年科技人才奖等奖项荣誉。担任中国生物物理学会电子显微学分会青年委员;《MedScience》青年编委;Nat CommunCell RepPlos BiolJ Med Chem等知名期刊学术审稿人。

教育经历:

2010.09-2014.07  西南大学,大学本科

2014.09-2020.09  中国科学院上海药物研究所,博士研究生,导师:H Eric Xu

2018.03-2019.03  美国 Van Andel 研究所,国际联培访学

 

工作经历:

2020.10-2021.10  中国科学院上海药物研究所,助理研究员

2021.11-2024.02  中国科学院上海药物研究所,副研究员

2024.03- 至今   上海交通大学,课题组长、研究员、博导

科研项目:

1. 2024YFA1307504,物理和人工智能双驱动的靶向蛋白质互作药物设计和筛选技术平台的研发与应用,国家重点研发计划,2024/12-2029/122500万元(总项目),125万元(课题四),项目骨干

2. 32401002,补体受体C5aR2特异性激活机制和新型选择性配体发现,国家自然科学基金青年项目,2025/01-2027/1230万元,项目负责人;

3. WH510363003/017,阿片受体G蛋白亚型信号偏向机制研究与靶向先导化合物发现,上海交通大学“交大2030”计划C类项目,2025/01-2025/1250万元,项目负责人;

4. KJ3-0221-23-6313,高水平地方高校一流师资队伍建设“医源”人才计划,上海交通大学医学院,2024/03-2030/02200万元,项目负责人;

5. 2023QNRC001,中国科协青年人才托举工程项目,2023/09-2025/1230万元,项目负责人;

6. 23YF1456700,补体受体C3aRC5aR介导的过敏毒素分子识别和信号传导机制研究,上海市启明星项目扬帆专项,2023/04-2026/0320万元,项目负责人;

7. 23ZR1475300μ型阿片受体变构调节分子基础及新型变构调节剂定向筛选,上海市自然科学基金面上项目,2023/04-2026/0320万元,项目负责人;

8. E1G707R078, 基于甲酰肽受体家族信号蛋白复合体的结构和生理功能研究, 中国科学院特别研究助理项目, 2020/10-2022/10, 80万元, 项目负责人

 

论文与专著:

(通讯作者:*;第一作者:#)

1. Zhuang, Y. #, Xu, P. #, Mao, C. #, Wang, L. #, Krumm, B. #, Zhou, X. E. #, Huang, S., Liu, H., Cheng, X., Huang, X. P., Shen, D. D., Xu, T., Liu, Y. F., Wang, Y., Guo, J., Jiang, Y., Jiang, H., Melcher, K., Roth, B. L. *, Zhang, Y. *, Zhang, C. *, Xu, H.E. *. Structural insights into the human D1 and D2 dopamine receptor signaling complexes. Cell. 184(4), 931-942 (2021). (封面文章)

2. Zhuang, Y. #, *, Wang, Y. #, He, B. #, He, X. #, Zhou, X. E., Guo, S., Rao, Q., Yang, J., Liu, J., Zhou, Q., Wang, X., Liu, M., Jiang, X., Yang, D., Jiang, H., Shen, J., Melcher, K., Chen, H., Jiang, Y., Cheng, X., Wang, M.W. *, Xie, X. *, Xu, H.E. *. Molecular recognition of morphine and fentanyl by the human μ-opioid receptor. Cell, 185(23), 4361-4375 (2022). Featured article, Cell年度最佳论文)

3. Wang, Y. #, Zhuang, Y. #, *, DiBerto, J. F. #, Zhou, X. E., Schmitz, G. P., Yuan, Q., Jain, M. K., Liu, W., Melcher, K., Jiang, Y., Roth, B. L. *, Xu, H.E. *. Structures of the entire human opioid receptor family. Cell, 186(2), 413-427 (2023). ESI高被引)

4. Xing, C. #, Zhuang, Y. #, Xu, T. H. #, Feng, Z. #, Zhou, X. E., Chen, M., Wang, L., Meng, X., Xue, Y., Wang, J., Liu, H., McGuire, T. F., Zhao, G., Melcher, K., Zhang, C. *, Xu, H.E. *, Xie, X. Q *. Cryo-EM structure of the human cannabinoid receptor CB2-Gi signaling complex. Cell, 180(4), 645-654 (2020).

5. Wang, Y. #, Liu, W. #, Xu, Y., He, X., Yuan, Q., Luo, P., Fan, W., Zhu, J., Zhang, X., Cheng, X., Jiang, Y., Xu, H.E. *, Zhuang, Y. *. Revealing the signaling of complement receptors C3aR and C5aR1 by anaphylatoxins. Nat Chem Biol, 19 (11), 1351-1360 (2023).

6. Fan,W. #, Xu,Y. #, He, X. #, Luo, P., Zhu, J., Li, J., Wang, R., Yuan, Q., Wu, K., Hu, W., Zhao, Y., Xu, S., Cheng, X., Wang, Y. *, Xu, H.E. *, Zhuang, Y. *. Molecular basis for the activation of PAF receptor by PAF. Cell Rep, 43(7), 114422 (2024).

7. Wang, Y., Xu, Y., Wang, Y., Zhang, J., Chen, L., He, X., Fan, W., Wu, K., Hu, W., Cheng, X., Yang, G., Xu, H.E. *, Zhuang, Y. *, Sun, S. *. Selective ligand recognition and activation of somatostatin receptors SSTR1 and SSTR3. PNAS, 121(41), p.e2400298121 (2024).

8. Fan, L., Zhuang, Y. #, Wu, H., Li, H., Xu, Y., Wang, Y., He, L., Wang, Shishan, Chen, Z., Cheng, J. *, Xu, H.E. *, Wang, Sheng *. Structural basis of psychedelic LSD recognition at dopamine D1 receptor. Neuron, 112(19), 3295-3310 (2024).

9. Zhuang, Y. #, Krumm, B. #, Zhang, H. #, Zhou, X. E., Wang, Y., Huang, X. P., Liu, Y., Cheng, X., Jiang, Y., Jiang, H., Zhang, C., Yi, W., Roth, B. L. *, Zhang, Y. *, Xu, H.E. *. Mechanism of dopamine binding and allosteric modulation of the human D1 dopamine receptor. Cell Res, 31(5), 593-596 (2021).

10. Zhuang, Y. #, Wang, L. #, Guo, J., Sun, D., Wang, Y., Liu, W., Xu, H.E. *. and Zhang, C. *. Molecular recognition of formylpeptides and diverse agonists by the formylpeptide receptors FPR1 and FPR2. Nat Commun, 13, 1054 (2022).

11. Zhuang, Y. #, Liu, H. #, Zhou, X. E., Kumar Verma, R., de Waal, P. W., Jang, W., Xu, T. H., Wang, L., Meng, X., Zhao, G., Kang, Y., Melcher, K., Fan, H., Lambert, N. A., Xu, H.E. *, Zhang, C. *. Structure of formylpeptide receptor 2-Gi complex reveals insights into ligand recognition and signaling. Nat Commun, 11, 885 (2020).

12. Liu, Q #, Yang, D #, Zhuang, Y. #, Croll, T. I., Cai, X., Dai, A., He, X., Duan, J., Yin, W., Ye, C., Zhou, F., Wu, B., Zhao, Q., Xu, H.E. *, Wang, M.W. *, Jiang, Y *. Ligand recognition and G-protein coupling selectivity of cholecystokinin A receptor. Nat Chem Biol, 17(12), 1238-1244 (2021).

13. Xu, P. #, Huang, S. #, Krumm, B.E. #, Zhuang, Y. #, Mao, C. #, Zhang, Y., Wang, Y., Huang, X.P., Liu, Y.F., He, X., Li, H., Yin, W., Jiang, Y., Zhang, Y. *, Roth, B.L. *, Xu, H.E. *. Structural genomics of the human dopamine receptor system. Cell Res, 33, 604-616 (2023). (Featured article)

14. Wang, Y. #, Guo, S. #, Zhuang, Y. #, Yun, Y. #, Xu, P. #, He, X., Guo, J., Yin, W., Xu, H. E. *, Xie, X. *, Jiang, Y *. Molecular recognition of an acyl-peptide hormone and activation of ghrelin receptor. Nat Commun, 12, 5064 (2021).

15. Luo, P., Xin, W., Guo, S., Li, X., Zhang, Q., Xu, Y., He, X., Wang Y., Fang, W., Yuan, Q., Wu, K., Hu, W., Zhuang, Y., Xu, H.E., Xie, X. Structural insights into the agonist activity of the nonpeptide modulator JR14a on C3aR. Cell Discov, 11(1), 7 (2025).

16. Duan, J. #, Shen, D.D. #, Zhou, X.E. #, Bi, P. #, Liu, Q.F., Tan, Y.X., Zhuang, Y., Zhang, H. B., Xu, P. Y., Huang, S. J., Ma, S. S., He, X. H., Melcher, K., Zhang, Y. *, Xu, H.E. *, Jiang, Y *. Cryo-EM structure of an activated VIP1 receptor-G protein complex revealed by a NanoBiT tethering strategy. Nat Commun, 11, 4121 (2020).

17. Wang, R., Sun, J., Liu, H., Guo, S., Zhang, Y., Hu, W., Wang, J., Liu, H., Zhuang, Y., Jiang, Y., Xie, X., Xu, H.E., Wang, Y. Molecular recognition of two approved drugs Macimorelin and Anamorelin by the growth hormone secretagogue receptor. Acta Pharmacol Sin, 1 (11), 2025.

18. Shi, Y., Ma, H., Zhuang, Y., Wang, X. X., Jiang, Y., Xu, H.E. C10ORF12 modulates PRC2 histone methyltransferase activity and H3K27me3 levels. Acta Pharmacol Sin, 40, 1457-1465 (2019).

19. Dutka, P., Mukherjee, S., Gao, X., Kang, Y., de Waal, P.W., Wang, L., Zhuang, Y., Melcher, K., Zhang, C., Xu, H.E., Kossiakoff, A. A. Development of “Plug and Play” Fiducial Marks for Structural Studies of GPCR Signaling Complexes by Single-Particle Cryo-EM. Structure, 27 (12), 1862-1874. e7 (2019).

20. Shi, Y, Wang, X, Zhuang, Y., Jiang, Y., Melcher, K., Xu, H.E. Structure of the PRC2 complex and application to drug discovery. Acta Pharmacol Sin, 38 (7), 963-976 (2017).

 

荣誉与奖励:

2025年   中国药学会科学技术奖一等奖(第六)

2024  MIT Technology ReviewTR35中国

2024年   上海市自然科学奖一等奖(第五)

2023年  赛诺菲优秀青年科技人才奖

2023年  中国科学院上海分院科技创新十大进展

2023年  首届浦东新区科技精英

2022年  上海科技青年35人引领计划获奖者

2021年  中国新锐科技人物突出成就奖

2021年  中国科学院百篇优秀博士学位论文

2020年  中国科学院院长优秀奖