科学研究
系统生物信息学、药物化学及化学生物学组
  作者:  2020-12-15

研究组长简介

  张健

 系统生物信息学、药物化学及化学生物学组

 电话:021-63846590-776922

 邮箱:jian.zhang@sjtu.edu.cn




 

   张健,上海交通大学特聘教授,药物化学与生物信息学中心主任,国务院学位委员会学科评议组成员,国家杰出青年基金、国家万人计划、长江学者奖励计划青年学者获得者。


研究方向与进展:主要从事药物设计、药物化学和化学生物学研究,特别是精准靶标识别和First-in-class原创药物先导发现等方向做出了一系列突破性成果。以通讯作者在包括Nat Chem Biol, Sci Adv, Am J Hum Genet, Nucleic Acids Res, Chem Sci等国际学术杂志上发表SCI论文100余篇。近年来代表性工作包括:(1)发展临床样本靶标识别方法识别抗肿瘤新靶标(Am J Hum Genet, 2017; Nucleic Acids Res, 2020)(2)发展变构药物设计方法发现多种全新变构活性分子(Nucleic Acids Res, 2011, 2014, 2016, 2018, 2019; Chem Sci, 2020)(3)研发抗肿瘤新靶标首个First-in-class药物先导,如SIRT6激动剂MDL-800APC/Asef互作抑制剂MAIT-203 (Nat Chem Biol, 2017, 2018; Sci Adv, 2019)。他引超过5000次,H因子为45,第一发明人申请国内外专利13(已授权6)。受邀以通讯作者在国际顶尖综述杂志Chem Rev (IF=54.3)Chem Soc Rev (IF=40.2)撰写变构药物机制综述,均作为封面文章重点推荐;受美国化学会旗舰期刊Acc Chem Res (IF=20.9)特邀回顾申请人10年来引领变构药物设计领域发展的贡献;受Springer-Nature出版社邀请作为主编撰写国际首本变构药物发现专著Protein Allostery in Drug Discovery;常年担任ScienceNat Chem70余种SCI期刊审稿人,澳大利亚FWF、新加坡IAF-PP等基金和西班牙University of Barcelona等学校Tenure考核的国际评审人。由于在精准靶标识别和First-in-class药物先导发现方面的贡献,获美国化学会Excellent Research Advisor、中国药学会生物医药创新奖、2017年中国十大科技新锐人物、Roche Creative Chemistry Award和药明康德生命化学研究奖等荣誉。现任国家卫健委卫生健康高级人才评价专家、中国化学会、中国药学会、中国医师协会精准医学委员会等专委会委员。


科研项目:国家杰出青年基金、基金委重大项目、重大新药创制等


代表性论文、专著与专利

5年代表性文章 (*为通讯作者)

  1. Lu S, Shen Q, Zhang J*. Allosteric methods and their applications: facilitating the discovery of allosteric drugs and the investigation of allosteric mechanisms. Acc Chem Res. 2019, 52(2): 492-500.

  2. Huang Z, Zhao J, Deng W, Chen Y, Shang J, Song K, Zhang L, Wang C, Lu S, Yang X, He B, Min J, Hu H, Tan M, Xu J, Zhang Q, Zhong J, Sun X, Mao Z, Lin H, Xiao M, Chin YE, Jiang H, Xu Y*, Chen G*, Zhang J*. Identification of a cellular active SIRT6 allosteric activator. Nat Chem Biol. 2018, 14(12): 1118-1126.

  3. Jiang H, Deng R, Yang X, Shang J, Lu S, Zhao Y, Song K, Liu X, Zhang Q, Chen Y, Chinn YE, Wu G, Li J, Chen G, Yu J*, Zhang J*. Peptidomimetic inhibitors of APC-Asef interaction block colorectal cancer migration. Nat Chem Biol. 2017, 13(9):994-1001.

  4. Huang M, Song K, Liu X, Lu S, Shen Q, Wang R, Gao J, Hong Y, Li Q, Ni D, Xu J, Chen G, Zhang J*. AlloFinder: a strategy for allosteric modulator discovery and allosterome analyses. Nucleic Acids Res. 2018, 46: 451-458.

  5. Shen Q, Cheng F, Song H, Lu W, Zhao J, An X, Liu M, Chen G, Zhao Z*, Zhang J*. Proteome-scale investigation of protein allosteric regulation perturbed by somatic mutations in 7,000 cancer genomes. Am J Hum Genet. 2017, 100(1): 5-20.

  6. Lu S*, Ni D, Wang C, He X, Lin H, Wang Z*, Zhang J*. Deactivation pathway of Ras GTPase underlies conformational substates as targets for drug design. ACS Catalysis. 2019, 9(8): 7188-7196.

  7. Liu X, Lu S, Song K, Shen Q, Ni D, Li Q, He X, Zhang H, Wang Q, Chen Y, Li X, Wu J, Sheng C, Chen G, Lu X*, Zhang J*. Unraveling allosteric landscapes of allosterome with ASD. Nucleic Acids Res. 2020, 48: 394-D401.

  8. Song K, Li Q, Gao W, Lu S, Shen Q, Liu X, Wu Y, Wang B, Lin H, Chen G, Zhang J*. AlloDriver: a method for the identification and analysis of cancer driver targets. Nucleic Acids Res. 2019, 47: 315-321.

  9. Yang X, Zhong J, Zhang Q, Qian J, Song K, Ruan C, Xu J, Ding K, Zhang J*. Rational Design and Structure Validation of a Novel peptide Inhibitor of the Adenomatous Polyposis Coli (APC)-Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor 4 (Asef) Interaction. J Med Chem. 2018, 61(17): 8017-8028.

  10. Lu S, Jang H, Muratcioglu S, Gursoy A, Keskin O, Nussinov R*, Zhang J*. Ras conformational ensembles, allostery and signaling. Chem Rev. 2016, 116(11): 6607-6665.


团队介绍:创新药物研发团队整合药物化学、生物信息学、分子/细胞生物学、药理学等学科技术,建立了“临床样本直接新靶点识别→变构药物设计和高通量筛选→药物化学研究→分子/细胞/动物水平功能确证→药理学和临床前研究→企业转化共同开发”的原创药物研发平台体系,从临床样本直接精准识别了新靶标,发现了一系列国际首次报道的先导化合物,部分化合物已全面开展临床前研究。这些新靶标和原创先导化合物的发现不仅充分说明了变构药物设计方法的先进性和高效性,同时为抗肿瘤First-in-class创新药物自主研究的突破提供了优质的活性物质基础