科学研究
RNA代谢与免疫疾病研究组
  作者:  2020-12-18

研究组长介绍

                                   

李华兵

电话: +86-18621822668 021-63846590-776794

邮箱:huabing.li@shsmu.edu.cn

 



个人简历

2020.5-至今 癌基因与相关基因国家重点实验室 研究组长(PI);上海交通大学医学院附属仁济医院 兼职教授

2019.5-至今 上海交通大学医学院-耶鲁大学免疫代谢研究院 研究员(PI)

2017.8-至今 上海交通大学医学院 上海市免疫学研究所 研究员(PI),博士生导师


2012-2017   美国耶鲁大学 博士后 导师:Richard A. Flavell

2011-2012   美国新泽西州立大学 博士后 导师:Vincenzo Pirrotta

2005-2011   美国新泽西州立大学 博士(Ph.D.) 导师:Vincenzo Pirrotta

2002-2005   南开大学 硕士(M.S.) 导师:宋文芹

1999-2002   南开大学 理学学士 (B.S.);耶鲁大学医学院免疫生物学系 客座助理教授(Assistant Professor Adjunct)


李华兵博士于南开大学本科(1999-2002)和硕士(2002-2005)毕业后,先后在国外知名顶尖实验室接受严格的系统科学训练, 在新泽西州立大学完成博士学位研究(2005-2011, 博士生导师:Vincenzo Pirrotta, Rutgers University,国际知名表观遗传学家), 在耶鲁大学完成博士后研究(2012-2017, 博士后导师:Richard Flavell, Yale University,国际著名免疫学家/美国国家科学院等三院院士)。2017年8月正式入职上海交通大学医学院上海市免疫学研究所,建立RNA代谢与免疫疾病课题组,并积极参入协助交大医学院、耶鲁、Richard Flavell院士和苏冰教授建立上海交通大学医学院-耶鲁大学联合免疫代谢研究院(Shanghai JiaoTong University School of Medicine – Yale University Institute for Immune Metabolism, SYIIM)。


在RNA表观遗传学和T 细胞免疫生物学交叉领域,李华兵研究员作为第一/共同第一作者、通讯/共同通讯作者已在Nature, Science,Cell Research,Immunity等国际一流期刊发表研究论文20 余篇。李华兵课题组主要从事免疫细胞中的RNA代谢的研究,以基因编辑小鼠的免疫疾病模型为基础,集中关注在机体免疫反应中RNA层面的表观修饰过程以及RNA结合蛋白的生理和分子生物学功能,通过前沿的高通量筛选测序和反向遗传学方法,鉴定出调控免疫反应的重要分子靶标,为开发肠道炎症、肝炎等自身免疫疾病以及相关肿瘤的治疗药物提供新策略新方法。


研究方向

目前已知RNA含有100余种化学修饰,其中m6A, m1A, m5C, pseudoUridine, APA是RNA上最主要的几种化学修饰。课题组团队在m6A领域已经做出了系列原创性研究,积累了扎实的学术基础和构建了坚实的实验平台。目前m6A的研究已经成为了一个热点领域,但是大家对于其它类型的RNA修饰关注不是很多,特别是不同的RNA修饰之间如何协调应对外界不同类型的刺激从而协同调控RNA的水平和功能鲜有研究。我们目前的初步研究成果表明各种不同的RNA修饰在T细胞激活的过程中发挥着关键的主动的作用,而且这些修饰之间存在着功能上的相互作用和协调。


在接下来的研究中将在以下几个方面开展工作:

(1)m1A RNA 表观遗传修饰对于其他免疫细胞功能的影响以及对肿瘤的治疗作用;

(2)pseudoUridine在免疫细胞中的功能以及其作用的分子机制;

(3)APA在免疫细胞中的功能以及其作用的分子机制;

(4)其它RNA结合蛋白在免疫细胞中的功能和分子机制;

(5)不同RNA修饰类型之间的协同作用及其规律。


科研项目

在研项目

1.上海交通大学医学院科研启动支持, 2017-2023,300万元,在研,主持

2.上海市教育委员会高校特聘教授(东方学者)计划,2018-2020,100万元,在研,主持

3.国家自然科学基金“生物大分子动态修饰与化学干预重大研究计划” 重大研究计划培育项目,91753141 ,“m6A RNA甲基化修饰动态变化对CD8 T细胞功能调控的研究”,2018/01-2020/12,70万元,在研,主持

4.中组部海外高层次青年人才计划,“免疫T细胞中RNA修饰的功能研究”,2018-2021,300万,在研,主持

5.上海市科委动物模型专项,2020-2021,20万,在研,主持

6.上海市科技创新行动计划,2021-2023,80万,在研,主持

7.国家自然科学基金医学部重点项目,2021-2025,297万,主持

8.国家自然科学基金生命学部面上项目,2021-2024,57万,主持


论文与专著

1. Li HB, Muller M, Bahechar I, Kyrchanova O, Ohno K, Georgiev P, and Pirrotta V. (2011) Insulators, not Polycomb Response Elements, are required for long-range interactions between Polycomb targets in Drosophila. Mol. Cell. Biol. 31(4):616-25. doi: 10.1128/MCB.00849-10. PMID: 21135119

2. Pirrotta V., and Li HB (2012). A view of nuclear Polycomb bodies. Curr. Opin. Genet. Dev. 22(2):101-9. doi: 10.1016/j.gde.2011.11.004. PMID: 22178420

3. Schwartz YB, Linder-Basso D, Kharchenko PV, Tolstorukov MY, Kim M, Li HB, Gorchakov AA, Minoda A, Shanower G, Alekseyenko AA, Riddle NC, Jung YL, Gu T, Plachetka A, Elgin SC, Kuroda MI, Park PJ, Savitsky M, Karpen GH, Pirrotta V. (2012) Nature and function of insulator protein binding sites in the Drosophila genome. Genome Res. 22(11): 2188-98. doi: 10.1101/gr.138156.112. PMID: 22767387

4. Li HB, Ohno K, Gui H, and Pirrotta V. (2013) Insulators target active genes to transcription factories and Polycomb-repressed genes to PcG bodies. PLoS Genet. 9(4):e1003436. doi: 10.1371/journal.pgen.1003436. PMID: 23637616 (Highlighted by Cell: 153(5), p935)

5. Li HB#, Jin C#, Chen Y#, Flavell RA. (2014) Inflammasome activation and metabolic disease progression. Cytokine Growth Factor Rev. 25(6):699-706. doi: 10.1016/j.cytogfr.2014.07.020. PMID: 25156419 (# equal contribution)

6. Zhu S#, Li HB#, Flavell RA. (2014) Resemble and Inhibit: When RLR Meets TGF-β. Mol Cell. 56(6):719-20. doi: 10.1016/j.molcel.2014.12.010. PMID: 25526529 (# equal contribution)

7. Cao G#, Li HB#, Yin Z, Flavell RA. (2016) Recent advances in dynamic m6A RNA modification. Open Biology. 6(4): 160003. doi: 10.1098/rsob.160003. PMID: 27249342 (# equal contribution)

8. Li HB. (2016) Chromosome Conformation Capture in Drosophila. Methods Mol. Biol. 1480:207-12. doi: 10.1007/978-1-4939-6380-5_18. PMID: 27659987

9. Hu B#, Jin C#, Li HB#, Tong J, Ouyang X, Cetinbas NM, Zhu S, Strowig T, Lam FC, Zhao C, Henao-Mejia J, Yilmaz O, Fitzgerald KA, Eisenbarth SC, Elinav E, Flavell RA. (2016) The DNA Sensing Aim2 Inflammasome Controls Radiation Induced Cell death and Tissue Injury. Science, 354 (6313): 765-768. DOI: 10.1126/science.aaf7532. PMID: 27846608 (# equal contribution)

10. Zhu S, Ding S, Wang P, Wei Z, Pan W, Palm NW, Yang Y, Yu H, Li HB, Wang G, Lei X, de Zoete MR, Zhao J, Zheng Y, Chen H, Zhao Y, Jurado KA, Feng N, Shan L, Kluger Y, Lu J, Abraham C, Fikrig E, Greenberg HB, Flavell RA. (2017) Nlrp9b inflammasome recognizes and restricts rotavirus infection in intestinal epithelial cells. Nature, 546(7660): 667-670. doi: 10.1038/nature22967. PMID: 28636595

11. Li HB#*, Tong J#, Zhu S#, Batista PJ, Duffy EE, Zhao J, Bailis W, Cao G, Kroehling L, Chen Y, Wang G, Broughton JP, Chen YG, Kluger Y, Simon MD, Chang HY, Yin Z*, Flavell RA*. (2017) m6A mRNA methylation controls T cell homeostasis by targeting IL-7/STAT5/SOCS pathway. Nature. 2017 Aug 17;548(7667):338-342. doi: 10.1038/nature23450. Epub 2017 Aug 9.. PMID: 28792938 (# equal contribution, * co-corresponding)

12. Tong J#, Cao G#, Zhang T#, Sefik E, Vesely M, Broughton J, Zhu S, Li H, Li B, Chen L, Chang HY, Su B, Flavell RA*, Li HB*. (2018) m6A mRNA methylation sustains Treg suppressive functions. Cell Research, 28(2): 253-256. doi:10.1038/cr.2018.7. PMID: 29303144 (*co-corresponding)

13. Yu X, Lao Y, Teng XL, Li S, Zhou Y, Wang F, Guo X, Deng S, Chang Y, Wu X, Liu Z, Chen L, Lu LM, Cheng J, Li B, Su B, Jiang J, Li HB*, Huang C*, Yi J* , Zou Q*. (2018) SENP3 maintains the stability and function of regulatory T cells via BACH2 deSUMOylation. Nature Communications. 2018 Aug 8;9(1):3157. doi: 10.1038/s41467-018-05676-6. PMID: 30089837 (* co-corresponding)

14. Tong J, Flavell RA*, Li HB*. (2018) RNA m6A modification and its functions in diseases. Frontiers of Medicine, 2018 Aug;12(4):481-489. doi: 10.1007/s11684-018-0654-8. PMID: 30097961 (* co-corresponding)

15. Yu X, Teng XL, Wang F, Zheng Y, Qu G, Zhou Y, Hu Z, Wu Z, Chang Y, Chen L, Li HB, Su B, Lu L, Liu Z, Sun SC, Zou Q. (2018) Metabolic control of regulatory T cell stability and function by TRAF3IP3 at the lysosome. J Exp Med. 2018 Sep 3;215(9):2463-2476. doi: 10.1084/jem.20180397. PMID: 30115741

16. Liu Y, Li HB*, Flavell RA*. (2018) cGAS activation in phased droplets. Cell Research, (2018) 0:1-2; doi: 10.1038/s41422-018-0087-6. PMID: 30218060 (* co-corresponding)

17. Wang J, Flavell RA*, Li HB*. (2019) Antiviral immunity: a link to bile acids. Cell Research, 2019 Mar;29(3):177-178. doi: 10.1038/s41422-019-0148-5. PMID: 30778178 (* co-corresponding)

18. Zhang X, Flavell RA*, Li HB*. (2019) hnRNPA2B1: a nuclear DNA sensor in antiviral immunity. Cell Research. 2019 Aug 30. doi: 10.1038/s41422-019-0226-8.

19. Hwang SS, Lim J, Yu Z, Kong P, Sefik E, Xu H, Harman CCD, Kim LK, Lee GR, Li HB, Flavell RA. (2020) mRNA destabilization by BTG1 and BTG2 maintains T cell quiescence. Science. 2020 Mar 13;367(6483):1255-1260. doi: 10.1126/science.aax0194. PMID: 32165587

20. Gao Y*#, Vasic R#, Song Y#, Teng R, Gbyli R, Biancon G, Nelakanti R, Liu C, Kudo E, Lobben K, Liu W, Ardasheva A, Fu X, Wang X, Joshi P, Lee V, Dura B, Viero G, Iwasaki A, Fan R, Xiao A, Flavell RA*, Li HB*, Tebaldi T*, Halene S*. (2020) Activation of Double-Stranded RNA Innate Immune Response and Hematopoietic Failure upon Loss of METTL3-Mediated m6A RNA Modification. Immunity. 2020 Jun 16;52(6):1007-1021.e8. doi: 10.1016/j.immuni.2020.05.003. Epub 2020 Jun 3. PMID: 32497523 (* co-corresponding)

21. Xu C*, Li HB*, Flavell RA*. A special collection of reviews on frontiers in immunology. Cell Research. 2020 Aug 28. doi: 10.1038/s41422-020-00403-7. (* co-corresponding)


团队介绍

实验室于2017年8月启动。截至2020年12月在实验室成员有1名助理研究员、4名技术员、5名博士后、4名博士生和2名硕士研究生。

郝亚娟 博士,助理研究员

毛凯琼 硕士,技术员

杨 媚 硕士,技术员

胡 昇 硕士,技术员

周亚韬 硕士,技术员


章 婷 博士,余㵑博士后

周 静 博士,上海市超级博士后(博新计划支持)

张兴利 博士,上海市超级博士后

王雪飞 博士,上海市超级博士后

李靖宇 博士,上海市超级博士后


巢怡农 2017级直博博士生

陈柏文 2018级博士生

缪珊 2019级直博博士生

陈韵竹 2020级直博博士生

陈慧芳 2018级硕士研究生

周艾炜 2020级硕士研究生