上海交通大学口腔医学院口腔学科是国家双一流建设学科、国家“九五”、“十五”和“十一五”三期“211”工程重点学科、是国家一流本科专业建设点，上海市“高峰”学科和上海市“高水平地方大学”建设学科，口腔临床医学（二级学科）是国家级重点学科，口腔基础医学（二级学科）是国家级重点（培育）学科和上海市（第三期）重点学科。

“十三五”期间，学科牵头主编国家级规划教材5部，获得国家级及省部级课程与教材建设项目24项，新增国家级及省部级实验和实践教学平台3个，入选国家虚拟仿真实验教学项目（国家级“金课”）1项，国家一流线下课程1门，牵头开展教学改革项目4项，国家级大学生创新项目9项，成果获得国家级教学成果二等奖1项、上海市教学成果一等奖1项、上海交通大学教学成果特等奖1项。

“十三五”期间，学科获全国创新争先奖1项、国家科学技术进步奖二等奖2项、高等学校科学研究优秀成果奖一等奖1项、高等学校科学研究优秀成果奖二等奖3项。获上海市科学技术进步奖一等奖3项。获中华口腔医学会科技奖二等奖2项、中华口腔医学会科技奖三等奖2项；获上海医学科技奖二等奖1项；获华夏医学科技奖二等奖2项、华夏医学科技奖三等奖2项。