附属新华医院科研中心引进超级计算机建立生物信息分析平台
2014-12-29 浏览( 来源:新华医院 
 撰稿:徐让
 摄影:

  在高通量测序技术广泛应用的今天,全球每天产生2EB(20亿GB)的生物数据,并以倍增态势迅速增加翻番。大量的基因组序列、蛋白质序列、基因多态、基因表达谱和蛋白质谱等产生的数据积累已远远超出了常规实验室的分析能力。建立超大规模计算系统,发展全新的生物信息学理论、方法来分析这些数据,从中获得有用信息成为基因组研究取得成果的决定性步骤。

  新华医院科研中心引进以AMD皓龙系统为运算核心的高性能计算机,初步建成生物信息分析平台。该高性能计算平台以中科曙光TC3600刀片系统为基础,总计算能力达到320个计算核心,1280G内存,64TB存储,并配备Infiniband高速互联系统,使计算性能得到更大提升。将为新华医院从事生物信息科研工作者们提供高速、海量的数据应用服务,为生物信息学研究提供了一个基于硬件、软件和数据库集成环境下的统一运行平台。

  张周博士是新华医院于今年引进的生物信息学人才,将全面负责该计算平台的管理运行,围绕高通量测序的基因组学数据分析与挖掘,建立大规模生物信息数据中心,用于基因组学的基础与临床研究。建成后的生物信息平台能够为全基因组测序、全外显子组测序、靶基因测序、转录组测序和全基因组甲基化测序等提供数据分析支持,满足基础和临床研究需求。

 

 

 
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