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2014年，中国科学院依据“率先行动”计划，依托上海生命科学研究院神经科学研究所，在脑科学领域设立中国科学院脑科学卓越创新中心。该中心的宗旨是针对脑科学领域具有本质性的重大科学问题进行攻关；造就具有国际竞争力的优秀人才，组建代表国家最高水平的精干研究队伍，形成团队攻关的体制机制；承担国家相关重大任务，以实现如下目标：以脑认知功能的神经基础为核心科学问题，同时研发脑研究新技术，并针对国家重大需求，开展脑疾病机理与早期诊断等有应用前景的前沿工作；充分利用我国数理、信息、材料、工程等交叉学科的专长、脑疾病样本的丰富资源和非人灵长类动物模型的优势，在脑科学前沿领域，取得国际领先的成果。 经过近两年的筹划与组织，2015年4月19日上海交通大学医学院-中国科学院神经科学研究所“脑疾病临床研究中心”正式成立。上海交通大学医学院党委书记孙大麟、中国科学院神经科学研究所所长蒲慕明、上海市卫生和计划生育委员会副主任肖泽萍、上海市教育委员会副主任袁雯、上海市科学技术委员会基础研究处处长傅国庆共同为中心揭牌，并推举医学院副院长陈红专教授和神经科学研究所熊志奇研究员为共同主任。 在成立大会上，医学院院长陈国强致欢迎词，中国科学院脑科学卓越创新中心主任蒲慕明研究员向出席会议的领导、中心学术指导委员会成员等介绍了脑疾病临床研究中心的筹建过程、定位和目标，中心旨在联合上海交通大学医学院与中国科学院神经科学研究所在脑科学与脑疾病方面的基础和临床的优势力量，组建目标明确，步骤清晰的联合攻关团队，将脑科学研究成果有效地转化于脑疾病的诊断和治疗中，在脑疾病的早期诊断、早期干预方面产出世界一流的重大成果。 在听取了蒲慕明主任的介绍后，中心学术指导委员会委员、上海交通大学医学院附属瑞金医院陈竺教授高度评价了中心的宗旨与目标，认为脑疾病临床研究中心的成立打破了固有的界限，为国立科研机构和大学之间架起了重要的桥梁。该中心作为生命科学研究机构和高等医学院校有机结合的创新实体，一定能在各方的努力支持下，为人民健康事业和脑科学发展做出应有的贡献。此外，陈竺教授还期望中心能够在体制机制方面实现创新，汇聚一批复合型的优秀人才，实现真正意义上的学科跨越。 成立大会后，中心召开了第一届学术指导委员会第一次会议，对中心率先启动的联合研究项目进行了评审。8位来自上海交通大学医学院附属医院的临床专家代表项目团队向学术指导委员会做了汇报。各位学术指导委员会委员在认真听取汇报后对每个项目进行了严格的评议并给出了各自的建议，并对中心今后的发展以及机制体制落地等方面提出了非常宝贵的指导意见。 中心的成立是上海交通大学医学院积极探索同城协同创新机制的又一尝试，也将为上海建设全球有影响力的科技创新中心以及亚洲医疗中心做出应有的贡献。
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