决赛开始前全场师生为沉痛哀悼雅安地震中逝去的同胞默哀，悼念在地震中逝去的生命，共同为雅安人民祈福。同时，本次会场入口签到处特设雅安赈灾募捐箱，筹得的所有善款将通过学校捐献给受灾地区。来自各社团的学生代表带领观众一同高唱《爱因为在心中》，祝福雅安。

　　本次决赛共分为三个环节，10位选手分成两组pk，其中6名选手晋级第二轮，经自由选择两两组合，产生三强，由评委评分得出最终比赛结果。首轮比赛中，韩国选手郑石松、学霸女王王思懿、消化医生孙罡、演唱能手孟戈直接晋级第三轮终极PK赛，其余选手进入第二轮投票环节。第二轮环节中，在各亲友团代表和外校嘉宾代表投票环节中，李鹏飞和李毅以高票进入本届青歌赛三甲的争夺。至此，冠亚季军将在这6位选手中产生。在第三环节两两PK赛中，李毅挑战孟戈，孙罡对战郑石松，王思懿勇战李鹏飞。 7号选手孙罡是来自九院消化科的一名医生，今晚的他脱下白大褂，站上青歌赛舞台。以一曲《醉赤壁》征服在场所有的观众。平时的学霸女生转身变为歌唱女王，王思懿完美演绎了一曲《halo》。孟戈呈献了一首《天使》尽显嘹亮歌喉。

　　青歌赛是医学院团委的品牌活动，至今已经走过二十余年。本次青歌赛由医学院团委、医学院学生会主办，在基层团委（总支）、各基层学生会的配合下，动员了近200名选手，涵盖了学生、教工、医务人员等多个层面的青年。经过4月10日复赛，从25名选手中产生了十强。本次活动还邀请了来自复旦大学上海医学院、同济大学医学院、上海中医药大学、第二军医大学的实力唱将一同助力本届青歌赛，同时为在场观众奉上了一场听觉盛宴。作为2013年上海交通大学医学院文化艺术节的开幕式活动，青歌赛不仅为喜爱唱歌的同学们提供了一个展示的平台，也为增强医学院的文化艺术氛围做出了贡献。