2012年3月，上海市教育委员会、上海市学位委员会公布“2011年上海市研究生优秀成果（学位论文）”（http://www.shmec.gov.cn/html/xxgk/201203/418062012007.php），医学院12篇博士学位论文和11篇硕士学位论文入选。据悉，本次共有156篇博士学位论文和132篇硕士学位论文入选“2011年上海市研究生优秀成果（学位论文）”，其中医学院校获奖近五十篇。
2011年底，教育部和国务院学位委员会批准发布全国优秀博士学位论文入选名单（http://www.cdgdc.edu.cn/xwyyjsjyxx/zlpj/yblwpm/ybdtxx/274537.shtml ），我院瑞金医院张小伟博士（导师陈竺）、叶静博士（导师吴云林）、谢冰博士（导师廉井财）以及基础医学院康迅雷博士（导师程金科）、王莹博士（导师徐凌云）等5篇博士学位论文获得了“全国优秀博士学位论文”提名。
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