据卫生部网站（卫办医政函【2010】641号）消息，为贯彻落实2010年《政府工作报告》中关于儿童白血病、儿童先心病“新农合”保障工作精神，保证试点工作顺利开展。日前，上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心被卫生部确认为儿童先心病、儿童白血病医疗保障试点工作区域协作中心之一，重点辐射江苏、浙江、安徽、福建、山东等区域的医疗保障工作。根据通知要求，区域协作中心的主要职责是：发挥专业医疗技术优势，提供技术指导，开展业务培训；建立疑难、危重病例会诊与讨论制度；建立患儿转诊和接诊机制，为患儿提供及时、合理、有效、费用适宜的诊疗服务。同时要求协商建立规范、便捷的转诊患儿跨省救治医疗费用的新农合结算报销办法。
儿中心作为国内首家通过JCI国际评审委员会认证的儿童专科医院，该院的心脏中心、血液肿瘤中心是国家重点学科和国家“211工程”重点建设学科，心脏中心也是卫生部唯一指定的“全国心血管疾病介入治疗继续教育培训基地”和首批“上海市临床医学中心”。其中，该院心血管学科已累计接受专科培训882人次，全国约有50%以上心血管学科到此接受培训，目前该院小儿先心病直视手术3000例（全球第一），总体手术成功率98%,处于国内领先、国际先进；血液肿瘤学科目前也是国内最大诊治中心之一，儿童急性淋巴细胞白血病5年无病生存率78%，儿童造血干细胞移植治疗累计超300例（国内第一），SCMC-2005-ALL治疗方案为卫生部推荐的临床指南，近期该学科与国际顶尖儿童癌症中心联合成立了国内首家“SCMC-St.Jude儿童癌症国际合作中心。
据悉，上海儿童医学中心已正式设立“新农合医疗保障办公室”，具体负责区域协作中心相关事宜的组织实施，并分别与山东、湖北、贵州等省的有关儿童医院签订合作协议，帮助、支持先心病筛查、技术指导和建立绿色转诊通道，与上海红十字会联合开展了二期先心病专项慈善救助。
