李琳,上海交通大学公共卫生学院,副研究员,学科带头人,2021年于中国科学院分子细胞科学卓越创新中心获得博士学位,师从陈洛南教授;2021年至2023年,开展博士后研究; 2024年至2025年任中心副研究员。课题组聚焦“生物数据驱动的因果网络推断和人工智能算法”研究,通过多学科交叉研究手段,解析复杂疾病的分子机制,为精准医学提供新方法和新工具,并推动其在疾病诊疗和和药物开发中的转化与应用。相关研究成果以第一作者(含共同)发表在Nature Genetics(2024,2020)、The Innovation和Genomics, Proteomics & Bioinformatics等生物信息学专业期刊。课题组已与多个高水平临床及湿实验研究组建立了稳定合作关系,具有丰富的临床标本和多模态数据库资源,打造了由数据挖掘和算法开发驱动的“临床问题出发”-“数据挖掘分析”-“实验功能验证”的闭环式研究体系。
代表性论文:
1.Guo WX#, Zhang XY#, Li L#, Shao PF#, Liang C#, Zhang HJ, Liu K, Wang SM, Peng YY, Luo J, Ju Y, Angelo M, Chen Y*., Chen LN*., Zhou B*., Gao D*. Intermediate cells with activated JAK/STAT signaling in prostate regeneration and diseases. Nature Genetics. 2024 Nov 15; 56, 2606–2607.
2.Li L#, Rui Xia#, Wei Chen#, Zhao Q, Chen LN*. Single-cell causal network inferred by cross-mapping entropy. Briefings in Bioinformatics, 2023.
3.Li L#, Xu YL#, Yan LL#, Li X, Li F, Liu Z, Zhang CC, Yuan Lou, Gao D, Cheng X, Chen LN; Dynamic network biomarker factors orchestrate cell-fate determination at tipping points during hESC differentiation, The Innovation, 2023.
4.Li L#, Tang H#, Xia R, Dai H, Liu R, Chen LN*. Intrinsic entropy model for feature selection of scRNA-seq data, Journal of Molecular Cell Biology, 2022. Li L#, Dai H#, Fang ZY*, Chen LN*. c-CSN: Single-cell RNA Sequencing Data Analysis by Conditional Cell-specific Network., Genomics, proteomics & bioinformatics, 2021, 19(11):319-329 Guo WX#, Li L#, He J, Liu Z, Han M, Li F, Xia XY, Zhang XY, Zhu Y, Wei Y, Li YG, Aji, R; Dai H; Wei H; Li CF, Chen Y, Chen LN*, Gao D*. Single-cell transcriptomics identifies a distinct luminal progenitor cell type in distal prostate invagination tips, Nature Genetics, 2020, 52(9): 908-918