系科介绍

​流行病学与生物统计学系

浏览量:时间:2021-05-18


一、系主任介绍

   

钟文泽,研究员,美国营养学会营养流行病组候任主席、美国心脏学会流行病与预防委员会青年委员。2012-2016年在美国北卡罗来纳大学教堂山分校攻读营养流行病学博士学位;2017-2019年在美国西北大学医学院预防医学系做博士后;2019-2020年担任康奈尔大学营养科学系tenure-track助理教授。从事糖尿病和心血管疾病流行病学、营养学、医学信息学和组学等跨领域研究,研究糖尿病和心血管疾病的病因、疾病进展、流行病学监测和预防策略。在美期间以PI身份获得美国政府、学会和学术机构的各项科研经费300多万美金。迄今在JAMA、JAMA Internal Medicine、Diabetes Care、International Journal of Epidemiology等顶尖期刊发表多篇第一作者和通讯作者论文,被纽约时报、华尔街日报、央视等300多家媒体报道超过600次,包括纽约时报专栏文章。2019年发表于JAMA的论文是该刊年度最受关注论文,Altmetric指数排名第一;在270万篇发表于2019年的论文中Altmetric指数排第23。担任JAMA、BMJ、 Annals of Internal Medicine、Diabetes Care等期刊的审稿人和仲裁人50多次。参与编写和评审美国NIH/NIDDK组织专家编写的权威糖尿病专著《Diabetes in America》第三版相关章节。多次荣获美国营养学会和美国心脏学会颁发的青年研究学者奖、博士后奖和博士生奖等,2020年获上海青年东方学者称号。

二、系介绍

流行病学与生物统计学专业成立于2003年,2013年公共卫生学院系重组后合并为流行病学与生物统计学系,现任主任钟文泽研究员。系科成立以来,流行病学与生物统计学系承担了23项国家级及省市级科研项目,累计科研经费约700万元,发表SCI收录论文50余篇,中文论文30余篇。现有教职员工13人,其中高级职称6人,中级职称7人,平均年龄34岁。本系近两年从欧美、香港等国内外知名高校引进多位青年人才,组成了一支非常年轻、有活力、有干劲和国际视野的队伍,力求不断发展成为国际化的新型流行病学与生物统计学系。本系科研的主要发展方向为高发慢性非传染性疾病的病因、进展机制、监测和预防,并从事COVID-19和HPV感染相关的传染性疾病的流行病学研究。在传统流行病学与生物统计学的基础上,着重发展生物信息学、医学信息学、人工智能(包括机器学习、自然语言分析、图像识别等)、多组学等方向,通过大数据和多学科交叉手段解决糖尿病、心血管疾病和癌症等慢性病的预防和管理等重大的公共卫生问题。

本系承担了多门必修课和选修课,包括:交大医学院预防医学专业《流行病学》、《卫生统计学》、《临床与分子流行病学》、《专业英语》课程,临床医学专业《流行病学与生物统计学》与《科研数据管理与统计分析》课程、食品卫生与营养专业《营养流行病学》与《卫生统计学》课程,以及公共选修课《生活中的毒理学》与《吃货的生物学修养》。本科教学工作量平均每年约700学时,研究生教学工作量平均每年约100学时。获得上海交通大学晨星优秀青年教师(C类)、第四届上海高校青年教学竞赛二等奖、教书育人三等奖等。

三、科研团队介绍

1、团队负责人:

钟文泽,研究员,美国营养学会营养流行病组候任主席、美国心脏学会流行病与预防委员会青年委员,前康奈尔大学营养科学系tenure-track助理教授。多次荣获美国营养学会和美国心脏学会颁发的青年研究学者奖、博士后奖和博士生奖等,2020年获上海青年东方学者称号。从事糖尿病和心血管疾病流行病学、营养学、医学信息学和组学等跨领域研究,研究糖尿病和心血管疾病的病因、疾病进展、流行病学监测和预防策略。在美期间以PI身份获得美国政府、学会和学术机构的各项科研经费300多万美金。迄今在JAMA、JAMA Internal Medicine、Diabetes Care、International Journal of Epidemiology等顶尖期刊发表多篇第一作者和通讯作者论文,被纽约时报、华尔街日报、央视等300多家媒体报道超过600次,包括纽约时报专栏文章。

2、主要研究方向和主要成果:

团队主要研究方向包括:(1)心血管代谢性疾病的病因、监测和预防:利用多个前瞻性人群队列和大型电子病历数据库,采用流行病学、组学、医学信息学、机器学习等手段研究糖尿病和心血管疾病的病因、预防和管理,以及人群流行病学监测。(2)大数据分析研究:和上海市疾病与预防控制中心合作,分析和深度挖掘上海市社区肿瘤筛查研究数据库,评价相关肿瘤社区筛查方法的诊断效能,结合危险因素建立发病风险判别函数,预测发病风险。(3)食品典型污染物数据清洗模式和风险评估模型研究:由上海市食品药品监督管理局科技情报研究所提供食品安全监测和检测相关数据库,开发食品安全数据结构化和智能化清洗技术,食品安全风险评估模型构建及软件开发。(4)社区老年人认知障碍及阿尔茨海默症队列研究:与黄浦区打浦桥街道社区卫生服务中心共建60岁及以上老年人的认知功能障碍筛查队列研究,致力于老年人认知障碍及阿尔茨海默症的干预及机制研究。(5)肝癌分子流行病学研究:首次阐明高糖可通过上调另一种蛋白翻译后修饰,O-连接的N-乙酰葡糖胺化(O-糖基化)促进肝癌细胞恶性表型;首次明确O-糖基化Hippo/YAP通路关键效应蛋白YAP可维持肝癌细胞恶性表型。(6)环境与健康分子流行病学研究:重点探究PM2.5通过诱导自噬和外泌体,参与肺癌的发生发展过程;筛选PM2.5诱导肿瘤防的防控新靶标,探讨利用药物靶向防控肿瘤的新机制。(7)心源性猝死的急救系统模式以及急性心血管疾病的机制研究:通过构建实用共享的心脏急救信息系统和卫生服务平台,完成心源性猝死的网络登记系统,研究成果被相关政府部门采纳,在多家急救中心应用收集数据,为建立更加完善的地区、国家急救医疗政策提供参考依据,推动地区、国家急救系统的建设。(8)肿瘤营养流行病学研究:在大型前瞻性队列中利用膳食炎症指数研究膳食的炎症效应与多种肿瘤发病和预后的关系;通过流行病学研究发现了膳食炎症程度可能通过改变肠道菌群的功能影响血液的炎症生物标记物水平。(9)临床研究方法学研究:包括临床研究项目的开发与设计、数据技术与应用、统计设计与分析、项目管理与质量控制,以及新药与医疗器械临床研究法规与注册等,并基于临床生物样本的大数据分析进行数学建模实践应用研究。(10)教学效果评价体系研究:保证教学质量并有效促进教学质量的提高,解决规模与质量之间的矛盾,实现规模、质量,效益之间相互促进的良性循环。教学质量评价是指在一定的教育价值观指导下,对教育教学活动及其效果进行价值判断的动态过程,为发展教学改革和改善教学管理提供依据。

团队近5年的主要科研成果包括:(1)国家级科研项目:国家自然基金项目7项;上海市卫计委项目1 项,上海市教委项目1项,上海市科委项目1项。(2)发表SCI论文:近5年团队以第一作者或通讯作者发表SCI论文30余篇。

四、系代表性科研成果介绍

(一)项目资助情况(国家级、省部级及局级科研项目)

1.国自然(面上):豆蔻酰化促肝癌的分子机制研究(81872288)

2.国自然(面上):PM2.5通过长链非编码RNA-HCG18\miR-195\Atg14通路调控肺癌发生发展的机制研究(21777099)

3.国自然(面上):基于多源大数据融合分析的院外心脏骤停急救快速反应体系优化策略研究(72074144)

4.国自然(青年):iNPC 定向分化为胆碱能神经元的实验研究(81401046)

5.国自然(青年):长链非编码RNA LOC146880在三手烟暴露导致女性非吸烟肺癌中的作用研究(81602929)

6.国自然(青年):糖尿病AGE/AGER信号通路调控YAP活性与肝癌发生的机制及流行病学研究(81301689)

7.国自然(青年):血红细胞NAD+水平对心肌梗死病人预后的影响及相关调控机制研究(81703303)

8.上海市卫计委:社区肺癌患者的右旋柠烯干预研究(20154Y0197)

9.上海市教委:糖尿病与肝癌发生分子流行病学研究(ZZjdyx13007)

10.上海市科委:“我能心急救”民众心肺复苏科普课程建设(20DZ2307000)

(二)代表性SCI论文(*通讯作者,#共同第一作者)

1.Zhong VW*, Ning H, Van Horn L, Carnethon MR, Wilkins JT, Lloyd-Jones DM, Allen NB. Diet quality and long-term absolute risks for incident cardiovascular disease and mortality.Am J Med. 2021 Apr;134(4):490-498.e24. (IF: 4.528)

2.Zhong VW*, Allen NB, Greenland P, Carnethon MR, Ning H, Wilkins JT, Lloyd-Jones DM, Van Horn L. Protein foods from animal sources, incident cardiovascular disease and all-cause mortality: a substitution analysis.Int J Epidemiol. 2021 Mar 3;50(1):223-233. (IF: 7.705)

3.Wang J, Ma T, Ma D, Li H, Hua L, He Q,Deng X*. The Impact of Air Pollution on Neurodegenerative Diseases.Ther Drug Monit. 2021 Feb 1;43(1):69-78. (IF: 2.071)

4.Xie Z, Chen M, Fu Z, He Y, Tian Y,Zhang X*, Feng N*. Thirdhand smoke beliefs and behaviors among families of primary school children in Shanghai.Tob Induc Dis. 2021 Feb 10;19:10.(IF=1.434)

5.Ye XF,Dong W, Tan LL, Zhang ZR, Qiu YL, Zhang J. Identification of the most appropriate existing anthropometric index for home-based obesity screening in children and adolescents.Public Health. 2020 Dec;189:20-25. (IF:1.771)

6.Zheng J,Hoffman KL, Chen JS, Shivappa N, Sood A, Browman GJ, Dirba DD, Hanash S, Wei P, Hebert JR, Petrosino JF, Schembre SM, Daniel CR. Dietary inflammatory potential in relation to the gut microbiome: results from a cross-sectional study.Br J Nutr. 2020 Nov 14;124(9):931-942.(IF: 3.332)

7.Dong XJ,Zhang L#, Yu YL, Shi SX, Yang XC, Zhang XQ, Tian S, Myklebust H, Li GH, Zheng ZJ. The general public's ability to operate automated external defibrillator: A controlled simulation study.World J Emerg Med. 2020;11(4):238-245. (IF:1.742)

8.Dong X,Zhang L#, Myklebust H, Birkenes TS, Zheng ZJ. Effect of a real-time feedback smartphone application (TCPRLink) on the quality of telephone-assisted CPR performed by trained laypeople in China: a manikin-based randomised controlled study.BMJ Open. 2020 Oct 5;10(10):e038813. (IF: 2.495)

9.Zhang L, Luo M, Myklebust H, Pan C, Wang L, Zhou Z, Yang Q, Lin Q, Zheng ZJ. When dispatcher assistance is not saving lives: assessment of process compliance, barriers and outcomes in out-of-hospital cardiac arrest in a metropolitan city in China.Emerg Med J. 2020 Sep 30;38(4):252–7. (IF:2.492)

10.Wang W, Lu M, Cai Y,Feng N*. Awareness and use of e-cigarettes among university students in Shanghai, China.Tob Induc Dis. 2020 Sep 8;18:76. (IF:1.432)

11.Wang H, Zhang B, Wang X, Mao J, Li W, Sun Y, Yuan Y, Ben Q,Hua L*, Qian A. TRPV4 Overexpression Promotes Metastasis Through Epithelial-Mesenchymal Transition in Gastric Cancer and Correlates with Poor Prognosis.Onco Targets Ther. 2020 Aug 21;13:8383-8394. (IF: 3.339)

12.Zhong VW*, Van Horn L, Greenland P, Carnethon MR, Ning H, Wilkins JT, Lloyd-Jones DM, Allen NB. Associations of Processed Meat, Unprocessed Red Meat, Poultry, or Fish Intake with Incident Cardiovascular Disease and All-Cause Mortality.JAMA Intern Med. 2020 Feb 3;180(4):503-512. (IF: 18.650)

13.Zhong VW, Kuang A, Danning RD, van Dam RM, Chasman DI, Cornelis MC. A genome-wide association study of bitter and sweet beverage consumption.Hum Mol Genet. 2019 Jul 15;28(14):2449-2457. (Ranked #2 among all HMG articles tracked by the Altmetric) (IF: 5.101)

14.Zhong VW, Juhaeri J, Cole SR, Shay CM, Gordon-Larsen P, Kontopantelis E, Mayer-Davis EJ. Proximal HbA1C level and first hypoglycemia hospitalization in adults with incident type 2 diabetes: a nested case-control study.J Clin Endocrinol Metab. 2019 Jun 1;104(6):1989-1998. (IF: 5.397)

15.Zhong VW*, Van Horn L, Cornelis MC, Wilkins JT, Ning H, Carnethon MR, Greenland P, Mentz RJ, Tucker KL, Zhao L, Norwood AF, Lloyd-Jones DM, Allen NB*. Associations of dietary cholesterol or egg consumption with incident cardiovascular disease and mortality.JAMA. 2019 Mar 19;321(11):1081-1095. (Top 100 Articles of 2019 by Altmetric (No. 23) & No. 1 in JAMA in 2019) (IF: 45.541)

16.Zhang G, He J,Ye X#, et al. β-Thujaplicin induces autophagic cell death, apoptosis, and cell cycle arrest through ROS-mediated Akt and p38/ERK MAPK signaling in human hepatocellular carcinoma.Cell Death Dis. 2019;10(4):255.(IF: 6.304)

17.Xu Z, Li Z, Liao Z, Gao S, Hua L, Ye X, Wang Y, Jiang S, Wang N, Zhou D,Deng X*. PM2.5 induced pulmonary fibrosis in vivo and in vitro.Ecotoxicol Environ Saf. 2019 Apr 30;171:112-121.(IF: 4.872)

18.Xu Z, Ding W,Deng X*. PM2.5, Fine Particulate Matter: A Novel Player in the Epithelial-Mesenchymal Transition?.Front Physiol. 2019;10:1404.(IF: 3.367)

19.Zhang L, Li B, Zhao X, et al. Public access of automated external defibrillators in a metropolitan city of China.Resuscitation. 2019;140:120-126.(IF: 4.572)

20.Zheng J, Wirth MD, Merchant AT, et al. Inflammatory Potential of Diet, Inflammation-Related Lifestyle Factors, and Risk of Pancreatic Cancer: Results from the NIH-AARP Diet and Health Study.Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2019;28(7):1266-1270.(IF: 4.344)

21.Li X,Huang H#, Xu H, et al. Excessive daytime sleepiness, metabolic syndrome, and obstructive sleep apnea: two independent large cross-sectional studies and one interventional study.Respir Res. 2019;20(1):276.(IF: 3.924)

22.Zhong VW, Juhaeri J, Mayer-Davis EJ. Trends in hospital admission for diabetic ketoacidosis in adults with type 1 and type 2 diabetes in England, 1998-2013: a retrospective cohort study.Diabetes Care. 2018 Sep;41(9):1870-1877. (Featured on the Cover) (IF: 16.016)

23.Zhou C, Shi Y, Chai P, Wu F, Xia W, He X, Shi Y,Huang H*, Jia R, Fan X. Contemporary update of overall prognosis and nomogram to predict individualized survival for Chinese patients with eyelid sebaceous carcinoma.Ebiomedicine, 2018;36:221- 228. (IF:6.68)

24.Yu X,Ye X*, Lin H, et al. Knockdown of long non-coding RNA LCPAT1 inhibits autophagy in lung cancer.Cancer Biol Med. 2018;15(3):228-237.(IF: 5.432)

25.Zheng J, Merchant AT, Wirth MD, et al. Inflammatory potential of diet and risk of pancreatic cancer in the Prostate, Lung, Colorectal and Ovarian (PLCO) Cancer Screening Trial.Int J Cancer. 2018;142(12):2461-2470.(IF: 5.145)

26.Zheng J, Tabung FK, Zhang J, et al. Association between Post-Cancer Diagnosis Dietary Inflammatory Potential and Mortality among Invasive Breast Cancer Survivors in the Women's Health Initiative.Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2018;27(4):454-463.(IF: 5.06)

27.Zhong VW, Juhaeri J, Cole SR, Kontopantelis E, Shay CM, Gordon-Larsen P, Mayer-Davis EJ. Incidence and temporal trends in hypoglycemia hospitalization in adults with type 1 and type 2 diabetes in England, 1998 to 2013: a retrospective cohort study.Diabetes Care. 2017 Dec;40(12):1651-1660. (IF: 16.017)

28.Zhang X,Qiao Y#, Wu Q, et al. The essential role of YAP O-GlcNAcylation in high-glucose-stimulated liver tumorigenesis.Nat Commun. 2017;8:15280.(IF: 12.121)

29.Feng N,Wang Y, Zheng M, Yu X, Lin H, Ma RN, Shi O, Zheng X, Gao M, Yu H, Garmire L, Qian B. Genome-wide analysis of DNA methylation and their associations with long noncoding RNA/mRNA expression in non-small-cell lung cancer.Epigenomics. 2017 Jan 23.doi: 10.2217/epi-2016-0120.(IF: 4.114)

30.Feng NN, Fang Y, Zhang YN, et al. Analysis of microRNA expression and micronuclei frequency in workers exposed to vinyl chloride monomer in China.Epigenomics. 2017;9(8):1093-1104.(IF: 4.114)

31.Deng X, Feng N, Zheng M, et al. PM2.5 exposure-induced autophagy is mediated by lncRNA loc146880 which also promotes the migration and invasion of lung cancer cells.Biochim Biophys Acta Gen Subj. 2017;1861(2):112-125.(IF: 3.422)

32.Feng N, Zheng G, Hao Y, et al. Mutations in apoptotic genes and micronucleus occurrence in vinyl chloride-exposed workers in China.Environ Mol Mutagen. 2017;58(1):39-45.(IF: 3.131)

33.Qiao Y, Zhang X, Zhang Y, et al. High Glucose Stimulates Tumorigenesis in Hepatocellular Carcinoma Cells Through AGER-Dependent O-GlcNAcylation of c-Jun.Diabetes. 2016;65(3):619-632.(IF: 7.72)

34.Feng N, Ching T, Wang Y, et al. Analysis of Microarray Data on Gene Expression and Methylation to Identify Long Non-coding RNAs in Non-small Cell Lung Cancer.Sci Rep. 2016;6:37233.(IF: 4.259)

(三)代表性中文核心期刊论文

1.唐玉青,谭靖宇,胡欣,黄光成,拱佳烨,徐庆,蔡惠勇,仇玉兰,冯楠楠.上海市社区老年人轻度认知障碍的潜在危险因素[J].公共卫生与预防医学,2020,31(02):126-130.

2.吴金铭,马丽芳,王佳谊,乔永霞.铁死亡的发生机制及其在肺癌中的研究进展[J].中国肺癌杂志,2020,23(09):811-817.

3.李慧敏,王健,卢银忠,蔡雨阳,邓晓蓓.PM_(2.5)对中枢神经系统功能及脂质代谢紊乱的影响[J].环境与职业医学,2020,37(10):1022-1029.

4.唐玉青,谭靖宇,胡欣,黄光成,拱佳烨,徐庆,蔡惠勇,仇玉兰,冯楠楠.上海市社区老年人轻度认知障碍的潜在危险因素[J].公共卫生与预防医学,2020,31(02):126-130.

5.黄光成,胡欣,唐玉青,谭靖宇,周峰,冯楠楠.同型半胱氨酸与阿尔兹海默症相关研究进展[J].公共卫生与预防医学,2019,30(06):85-89.

6.王昊,江杉,龚杨明,刘燕,华丽,邓晓蓓.大气细颗粒物通过嗅球途径导致阿尔茨海默病的机制研究进展[J].上海交通大学学报:医学版,2019,39(6):666-670.

7.董雪洁,潘纯,王亮, 等.苏州市医务人员心脏急救理论和操作能力现状研究[J].中国急救复苏与灾害医学杂志,2019,14(1):46-50.

8.谭镜璁,仇玉兰.基于粪便样本的大肠癌筛查技术概况[J].现代预防医学,2018,45(17):3178-3181.

9.黄亨烨,施悦,仇玉兰, 等.国内临床试验方案常见问题与报告规范的探讨[J].中华医学科研管理杂志,2018,31(3):161-166.

10.黄亨烨,张硕,冯铁男, 等.大学附属医院医师临床研究能力与培训需求分析[J].中华医学科研管理杂志,2017,30(4):293-299.

11.华丽,曹国君,邢志芳, 等.血尿酸、三酰甘油及高密度脂蛋白对冠心病及其严重程度的联合风险评估[J].国际检验医学杂志,2016,37(24):3410-3413.

12.华丽,曹国君,邢志芳, 等.血尿酸与冠心病及其严重程度相关性研究[J].国际检验医学杂志,2016,37(15):2061-2064.

13.梁彤彤,郑志杰,乔永霞.糖尿病与原发性肝癌关系及作用机制的研究进展[J].中华预防医学杂志,2014,48(10):921-924.

(四)获奖及各级人才情况

1.2020年,上海市青年东方学者(钟文泽)

2.2020年,上海市浦江人才计划,饮食炎症指数及相关膳食模式与脂肪肝发病及其恶性转变的关联和机制研究(20PJ1409600)(郑加荔)

3.2018年,生活方式与心血管代谢健康委员会青年研究学者奖(Council on Lifestyle and Cardiometabolic Health Early Career Investigator Award),美国心脏学会 (American Heart Association)(钟文泽)

4.2018年,Roger R. Williams遗传流行病学及动脉粥样硬化防治奖(Roger R. Williams Award for Genetic Epidemiology and the Prevention and Treatment of Atherosclerosis),美国心脏学会 (American Heart Association)(钟文泽)

5.2018年,Jeremiah and Rose Stamler青年研究学者入围奖(Jeremiah and Rose Stamler Research Award for New Investigators),美国心脏学会 (American Heart Association)(钟文泽)

6.2017年,上海市浦江人才计划,心源性猝死的急救系统模式研究、体系构建、及相关新技术的研发推广(17PJC070)(张琳)