1988年，为加快推进汕头大学医学院的建设，国家教委明确提出由上海第二医科大学（上海交大医学院的前身）支援汕头大学医学院及其附属医院的建设。同年2月26日，上海第二医科大学与汕头大学在广州正式签署协作协议书。
上海第二医科大学对汕头大学的援建共计十年，分两个阶段进行。第一个五年计划，主要是提高基础和临床教学质量，筹建汕头大学医学院第一附属医院，并采取多种形式培养师资力量。第二个五年计划，重点转向提高学术水平和人才培养，着重提高研究生的培养质量，提高科研水平和加强重点学科的建设。
十年中，上海第二医科大学共派遣专家、教师195人参加汕大医学院的工作，同时接受汕大医学院各类干部和业务骨干及实习学生到二医学习培训。在教学上，汕大医学院全盘沿用二医的整套教学管理制度和临床教学管理体系，不断加强研究生的教育和培养。在医疗上，协助附属医院的筹建并全面顺利开诊，特别是协助附一院的重点学科建设，开展了六十多项新技术的应用，最终助其成为三级甲等医院。在科研上，通过援建教师的指导和传教，逐步提高青年教师的科研意识与科研能力，并开展了多项科研协作和实验室建设项目，帮助汕头大学医学院中标广东省高教局课题，并于1997年通过211工程预审。