上海交大医学院系统从1997年起持续开展援疆工作，二十多年来，已有10批援疆干部、医疗队奔赴阿克苏和喀什等地区对口支援。上海交大医学院克服种种困难，充分利用自己的人才优势、技术优势和资源优势，积极扶持和推动新疆医疗卫生事业的发展，服务保障各族群众，为新疆地区医疗水平的不断提升和当地人民奔小康做出了贡献。

近年来，上海交大医学院每年分批、分次派出不同学科、不同岗位的高素质专业人才，不仅加强喀什二院的学科建设，从无到有地建立了新生儿科、肾内科、血透室、中医科等科室，更是积极开展人才梯队的培养，常态化组织参加国家级师资培训及各职能管理人员的专题培训，为喀什二院打造出一支带不走的人才队伍。2014年，喀什地区第二人民医院成功地从一家普通的专科医院蜕变为三级甲等医院，门诊满意率达到98%。

在多年的援疆工作实践中，医学院人开创的上海“组团式”医疗援疆新模式，得到了中组部、国家卫健委、人社部、教育部等四部委的充分认可。他们以无比坚定的信念，以创新性的全资源整合、全方位援建、全身心投入、全过程管理理念，全面、深入、持续帮扶喀什，用科学与规范为当地百姓健康筑起一道道安全屏障，缔造了一系列南疆乃至全疆的医学纪录，开创了南疆（喀什）新型医疗联合体，实现了跨越式发展，有效推动了新疆喀什地区医疗卫生事业的发展。