医学院持续深化国际合作，注重对外交流，医学教育国际化水平不断提高。已与21个国家和地区的70所大学及科研机构开了了广泛的合作。推动加强和世界顶级大学的科研合作，建立了上海交通大学医学院单细胞组学与疾病研究中心、与英国爱丁堡大学共建 “全健康研究中心”。与21个国家的71所大学和机构开展了约55个海外游学项目，本科生短期境外访学比例达50.4%。近年来，与世界一流院校合作，拓展并实施多个线上游学项目，使学生不出国门也能享受优质国际教育资源，提升国际视野。国际学生教育工作稳步发展，2020年顺利通过了中国教育国际交流协会组织的来华留学质量认证，成为目前全国首家唯一获得八年认证期的高校。