【课题组长简介】
丁俊,研究员/PI,博士生导师,国家级青年人才项目入选者。长期从事单细胞多组学深度生成建模、细胞动力学系统解析及虚拟疾病模型与AI药物发现研究。课题组研究方向: 课题组聚焦于基于单细胞与空间多组学数据的深度生成模型与疾病动力学建模。2024–2025 年期间,课题组在 Nature 与 Cell 系列期刊发表论文 8 篇,在 NAR、Genome Research、Genome Biology 等 IF>10 主流期刊发表论文 3 篇,另有多项 CNS 研究工作处于再审与修订阶段。相关成果主要由学生担任第一作者完成,在较小规模团队下,维持年均人均 ≥1 篇 IF≥10 研究论文的稳定产出节奏。
重点方向包括:
1. 单细胞多模态生成建模与表征学习
2. 细胞命运及疾病演化建模
3. 深度生成模型(VAE、Diffusion、Flow、GNN等)
4. LLM驱动的虚拟扰动与靶点评估
5. AI药物再定位与分子设计
【岗位类型】
因发展需要,现招聘助理研究员/副研究员(编制)1名及博士后2-3名。
(一)助理研究员/副研究员
【岗位要求】
具有国内外知名大学博士学位,应聘者一般应在40周岁以下,需具有博士后经历;
具有深度生成模型经验;熟练PyTorch有单细胞或AI药物发现背景优先;
发表过最少3篇一作/通讯作者国际期刊论文(IF>10),工具类文章需提供GitHub链接。有CNS子刊者,数量要求可协商
【岗位职责】
独立或协助课题组长开展科研工作:建模虚拟细胞与疾病动力学;
协助课题组长指导研究生;
协助课题组长处理实验室相关行政事务;
协助课题组撰写基金和申报课题等相关工作。
【薪资待遇】
应聘者一经录用,其工资、福利和社会保险等相关待遇按上海交通大学医学院有关规定执行,具体情况面议。
(二)博士后 2-3名
【岗位要求】
在计算机、数学、统计、人工智能等相关领域获得博士学位,身心健康,年龄一般不超过35周岁;
掌握深度学习与PyTorch framework,以第一或者通讯作者发表3篇及以上sci论文;
自我驱动性强,对虚拟细胞和疾病模拟有浓厚兴趣,希望用深度学习来提升复杂疾病疾病诊断和治疗(特别是ai辅助药物设计);
熟悉单细胞组学,熟练使用各种各种单细胞组学工具(Seurat, scanpy)。
【岗位职责】
1)参与模型构建与虚拟扰动研究;
2)发表高水平论文。
【薪资待遇】
提供有竞争力的薪酬待遇,缴纳社保公积金,可申请上海市公租房或上海交通大学医学院博士后公寓,参照事业编制人员享受体检待遇,享有学校公共资源服务等;支持申报医学院博士后激励计划、上海市“超级博士后”激励计划、全国博士后创新人才支持计划等各级基金及人才计划。
【申请方式】
请应聘者撰写个人简历(包括研究兴趣、学习和工作经历、科研业绩、发表文章、机器学习技能、获奖情况等)和3份推荐信发送至:junding@shsmu.edu.cn。邮件标题请注明“姓名+应聘岗位”。申请者信息将严格保密,初审合格者通知面试。
上海交通大学医学院公共卫生学院
2025年12月