新华临床研究中心成立于2015年，中心作为医院‘十三五’规划的重要组成部分，成功搭建了临床研究的基础设施。2019年5月，上海交通大学医学院临床医学研究院（原上海交通大学医学院临床研究中心）新华医院分中心正式挂牌成立。2020年，中心升级为‘CRU2.0’，在申康中心的指导下，形成了 包括临床研究中心、GCP和临床大数据中心‘三位一体’的创新模式，称为临床研究与创新中心，进一步提升了研究能力与管理水平。
该中心是上海第一家基于医院的临床研究系统化支撑创新平台性机构，与加拿大渥太华大学医学院和美国哈佛医学院深度合作，汇聚医生、临床流行病学家、临床药师、统计学家，遵循国际化的科学水平和伦理标准，搭建了临床研究的协作网络，推动临床研究项目的质量提升，并为临床医学研究成果的转化提供规范化途径，充实了临床研究人才库。
在临床研究中心的支撑下，依托上海交通大学医学院生命早期健康研究院，“千天计划”——国内首个探索人类重大发育源性疾病的航母级临床研究项目已取得初步进展，该项目在生命早期健康领域的研究成果将有力的推动我国妇幼健康以及相关政策的决策科学水平迈上一个新台阶。作为上海申康第二轮临床三年行动计划临床研究项目数据管理组长单位，积极推进“重大专病队列数据库与生物样本全息库建设项目”和“特色专病队列数据库建设项目”建设，建立以专病诊疗规范和临床路径为基础的结构化专病数据集标准，开展临床专病登记研究，构建特色专病队列，涵盖儿童心血管病、肝癌等多种疾病，开展高质量的真实世界临床研究。这些专病数据库不仅为高质量临床研究提供了基础支撑，也为未来的医学研究积累了宝贵的数据资源。
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