上海交通大学医学院临床医学研究院位于上海交通大学医学院黄浦校区，在原上海交通大学医学院临床研究中心（2017年）基础上发展建设，于2025年10月26日正式揭幕成立，是上海交通大学医学院下设二级科研机构。

临床医学研究院（以下简称“研究院”）秉承“面向世界科技前沿、面向国家重大需求、面向人民生命健康”的发展理念，以临床医学研究为核心，结合临床转化研究、临床科学研究和实验研究，打造国际一流的综合性临床研究方法学创新平台。研究院将构建以临床需求为导向的多学科交叉研究体系，开展高水平临床研究，推动临床医学研究模式的创新，促进前沿临床医学成果的开发和应用，为国家医学科技自立自强创新体系建设贡献力量。通过建设高水平人工智能临床研究平台和数据管理体系，整合13家附属三甲医院的临床资源，打造国家级大型人群队列和生物样本库平台，构建医学院-附属医院两层级协作网络，旨在全面提升临床医学科研能力和服务能力。研究院将重点突破数据壁垒，实现医疗大数据开放共享，建立国际规模的医疗通用人工智能平台，为疾病诊断、药物研发和成果转化提供支撑；同时通过建设国家级临床研究人才培养中心，开展实践教育培训项目，建立远程共享临床试验平台，扩大临床研究人才引育范围，引领国内临床研究规范发展。依托重庆南路校区的枢纽优势，研究院将汇聚国内外高水平人才，充分发挥附属医院网络辐射作用，切实解决临床研究资源紧缺问题，推动我国临床医学研究的高质量发展。

目前，研究院已成立10家附属医院临床研究分中心及1家护理学院临床研究分中心，构建全国规模最大的“医学院-附属医院”临床研究协作网络，建立高效合作机制，提升多中心临床试验的启动效率、质量控制能力与项目承载力，提升平台创新能级，支撑开展高水平高质量的全国多中心临床试验，支持附属医院专家在NEJM, JAMA, Lancet Digital Health发表论文，为交大医学院突破ESI万分之一，提升医学科技创新作出积极贡献。同时，研究院重点建设上海市临床研究专业技术服务平台这一省部级平台，提升上海市临床研究水平，增强临床研究策源能级，做强生物医药创新引擎。

研究院下设综合事务管理办公室、科研办公室，按功能服务设置临床研究设计部、数据管理质控部、信息与智能研究部、临床研究转化部、生物统计教研室、临床研究评价部，依托诊断——分析——预后预测一体化人工智能平台、独立影像评估平台、智能化临床试验设计平台、多组学分析等技术平台，实现从临床试验设计、数据收集和预处理、多组学分析到临床研究全流程管理的数字化支撑，形成“资源整合——技术赋能——人才培育——成果转化”的闭环运行机制。

研究院将以建设具有示范引领作用的高水平临床医学研究平台为发展愿景，致力于构建国际一流的临床医学研究体系，持续发挥示范辐射作用，建设成为国际知名的临床医学研究高地，为“健康中国2030”规划和临床医学发展贡献中国智慧和上海方案。