史卫峰-上海市病毒研究院

1. 中国昆虫学会第十一届理事会媒介昆虫与病原互作专业委员会，委员

2. 中国微生物学会病毒学专业委员会第二届青年委员会，副主任委员

3. 中华预防医学会生物信息学分会第一届委员会，委员

4. 中华医学会微生物与免疫学分会第十一届委员会，委员

5. 《中华预防医学杂志》第十一届编辑委员会，通讯编委

6. 《中华实验和临床病毒学杂志》第六届编辑委员会，编辑委员

7. PLoS Pathogens, Editor

8. Zoological Research, Editor

9. Virologica Sinica, Editor

10. Vita Microbiology, Deputy Editor

11. iMeta, Editor

1. AI for Virology病毒宿主互作机制研究：基于人工智能模型解析病毒与宿主天然免疫/固有免疫系统的互作网络，筛选关键病毒受体与宿主因子，发现抗病毒靶点并设计广谱疫苗。

2. 中国病毒组计划与新病毒发现：利用宏转录组测序系统刻画野生动物、家养动物及不同生态区中的病毒多样性与分布格局，构建我国病毒多样性本底数据库，识别潜在的人畜共患风险病毒。

3. 新发病毒的进化、传播与跨宿主适应：综合系统发育动力学、生态环境因素和社会经济变量，研究具有感染人潜力病毒的演化轨迹、突变模式及宿主转换机制，揭示病毒传播和适应的遗传决定因素。

4. 基于多组学的蜱-病毒互作与媒介生态研究：整合基因组学、转录组学和蛋白组学，研究蜱及其相关病毒组的组成、维持、复制与传播机制，解析影响媒介种群中病毒持续存在的生物学和环境因素。

1. Zhou H†, Liu H†, Wang YX†, Zhao S†, Guo M, Cui M, Chen J, Li J, Wang S, Zhang X, Qin J, Lv Z, Ma Z, Zhang R, Zhang B, Zheng W, Ji J, Wang T, Holmes EC, Wang YZ*, Shi W*. The risk of human- and mammal-infecting tick-borne viruses in northwest China and adjacent countries. Nature Communications. 2026;17:175. DOI: 10.1038/s41467-025-66873-8

2. Li C, Holmes EC, Shi W*. The diversity, pathogenic spectrum, and ecological significance of arthropod viruses. Trends in Microbiology. 2025;33(8):826-838. DOI: 10.1016/j.tim.2025.03.005

3. Yang J†, Li J†, Sun J†, Li J†, Fu G†, Tian T†, Yang Y†, Lu X, Li S, Wang L, Dong J, Wu M, Liu Y, Li D, Hu D, Dong H, Shang R, Wang Y, Yuan K, Ran L, Sun H, Tian W, Huang Y, Liu J, Liu W, Shi W*, Gao GF*, Bi Y*. Genetic diversity of H9N2 avian influenza viruses in poultry across China and implications for zoonotic transmission. Nature Microbiology. 2025;10(6):1378-1392. DOI: 10.1038/s41564-025-02002-x

4. Zhou H, Xu L, Shi W*. The human-infection potential of emerging tick-borne viruses is a global public health concern. Nature Reviews Microbiology. 2023;21(4):215-217. DOI: 10.1038/s41579-022-00845-3

5. Zhang Z†, Zhou H†, Cao H†, Ji J, Zhang R, Li W, Guo H, Chen L, Ma C, Cui M, Wang J, Chen H, Ding G, Yan C, Dong L, Holmes EC, Meng L*, Hou P*, Shi W*. Human-to-human transmission of Chlamydia psittaci in China, 2020: an epidemiological and aetiological investigation. Lancet Microbe. 2022;3(7):e512-e520. DOI: 10.1016/S2666-5247(22)00064-7

6. Zhou H†, Ji J†, Chen X†, Bi Y†, Li J, Wang Q, Hu T, Song H, Zhao R, Chen Y, Cui M, Zhang Y, Hughes AC*, Holmes EC*, Shi W*. Identification of novel bat coronaviruses sheds light on the evolutionary origins of SARS-CoV-2 and related viruses. Cell. 2021;184(17):4380-4391. DOI: 10.1016/j.cell.2021.06.008

7. Li J†, Lai S†, Gao GF, Shi W*. The emergence, genomic diversity and global spread of SARS-CoV-2. Nature. 2021;600(7889):408-418. DOI: 10.1038/s41586-021-04188-6

8. Shi W*, Gao GF*. Emerging H5N8 avian influenza viruses. Science. 2021;372(6544):784-786. DOI: 10.1126/science.abg6302

1. 国家科技重大专项：基于人工智能的呼吸道感染重要病原体复制关键共性机制及干预靶点研究，2025.12-2028.11，项目负责人，经费 3475 万元。

2. 国家自然科学基金杰出青年基金项目：新发传染病溯源与反向病原学，2024.01-2028.12，项目负责人，经费 400 万元。

3. 国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目：中俄迁徙候鸟禽流感病毒流行规律及跨宿主感染风险研究，2026.01-2028.12，合作单位负责人，经费 50 万元。

4. 国家自然科学基金项目：我国不同民族健康成年人上呼吸道病毒组多样性及其形成机制研究，2024.01-2026.12，课题负责人，经费 170 万元。

5. 国家重点研发计划子课题：大流行风险病毒的监测、传播规律及预警研究，2023.12-2026.11，子课题负责人，经费103.8万元。

6. 上海市科学技术委员会项目：一株新型野生动物来源Beta冠状病毒鉴定及感染人机制研究，2023.04-2026.03，课题负责人，经费 20 万元。

7. 上海市教委“人工智能促进科研范式改革赋能学科跃升计划”重点项目：基于人工智能的新发 RNA 病毒人畜共患风险评估研究，2024.09-2025.12，项目负责人，经费 50 万元。

8. 上海交通大学“交大之星”计划医工交叉研究基金：基于深度学习的新发 RNA 病毒蛋白结构与潜在生物学功能研究，2023.01-2025.12，项目负责人，经费 50 万元。

研究生培养：现指导上海交大博士研究生 7 人、硕士研究生 5 人。

博士后培养：指导博士后 5 人，其中入选国家博新计划 1 人次、上海市“超级博士后”激励计划 1 人次、博士后海外引才计划 1 人次；指导博士后获得上海市自然科学基金、上海市启明星项目（扬帆计划）、博士后面上项目等资助。

团队现有助理研究员1名，实验技术员1名。作为任务负责人参与国家重大专项 2 项，获得上海市启明星项目（扬帆计划）1 项、上海市公共卫生研究专项 1 项。

邮箱：shiwf@ioz.ac.cn

办公地址：上海市浦东新区天雄路166号7号楼2楼