院史馆坐落于医学院东院6舍。该楼建造于上世纪四十年代，为砖木结构建筑物，共三个楼层，原用途为后勤用房，室内公共部位及室外墙体已现开裂、涂料剥落等现象，且屋面破损、漏水现象频发。经医学院讨论决定，于2016年将东院6舍改造为院史馆，装修面积约1000平方米。

该院史馆设计紧扣“教书育人”“百年树人”的理念，彰显医学院历史文化特色。展示区为上下二个层面，分为前言、领导关怀、杏林英华、薪火传承、百年树人、创新之光、厚德为医、博采众长、精神家园、后记等版块，设有多媒体互动体验区和留言休息区。同时以声光电等多种形式，配有许多珍贵的实物档案资料，展现了医学院发展的文化历史脉络和建设丰硕成果。