2019年1月，中共上海交通大学公共卫生学院总支委员会升格调整为中共上海交通大学公共卫生学院委员会。学院以提升组织力为重点，不断健全党的基层组织。学院党委在系（科）上建立党支部，工会和妇女小组，完成学院各级党群组织换届改选工作，并根据人员流动情况及时进行调整。开展的主要工作有：由于新进党员人数多而且相对集中，2018年12月，在原有第二党支部的基础上成立第五党支部；2019年4月，上海交通大学临床研究中心党员其组织关系全部转入公共卫生学院党委，学院成立了第六党支部。