九三学社上海交通大学医学院组织始建于1956年5月，当时称九三学社二医支社筹委会。1957年1月正式成立九三学社二医支社委员会，1990年成立九三学社上海第二医科大学第一届委员会。截止2010年底，共有237名社员。

九三学社上海交通大学医学院第六届委员会（2011年9月16日）
主  委：陈绍行 
副主委：李青峰、林建华、顾鸣敏、陈敏怡
委  员：谢  青、李培勇、仇晓华、是俊凤、汪  俊、徐卓明、刘俊岭
主委助理：董云霓

委员会下设六个支社
院本部支社  主委：顾鸣敏，副主委：刘俊岭  王高潮
瑞金支社    主委：谢  青，副主委：王学锋  彭承宏
仁济支社    主委：林建华，副主委：张纪蔚  倪醒之  仇晓华
新华支社    主委：是俊凤，副主委：陈颖伟
九院支社    主委：李青峰，副主委：汪  俊、刘  清
儿中心支社  主委：徐卓明，副主委：钟玉敏

组织发展历程
九三学社上海第二医学院支社筹委会（1956年5月） 社员10名
主  委：余  氵贺     副主委：倪葆春

九三学社上海第二医学院第一届支社（1957年1月）
主  委：倪葆春   副主委：余 氵贺  、叶衍庆

九三学社上海第二医学院第二届支社（1959年）
主  委：余  氵贺    副主委： 童致棱

发展至1966年，共有社员40人。
文革期间停止活动，1976年后逐渐恢复活动。

九三学社上海第二医学院第三届支社（1980年）
主  委：倪葆春   副主委： 王一山、曹裕丰、陈仁彪

九三学社上海第二医学院第四届支社（1983年）
主  委：曹裕丰   副主委： 王一山、陈仁彪、张锡泽、汪道新

九三学社上海第二医学院第五届支社（1987年）
主  委：陈仁彪   副主委： 王一山、汪道新、吴生一

九三学社上海第二医科大学第一届委员会（1990年）  96人
（下设院本部支社、瑞金支社、仁济支社、新华支社）
主  委：陈仁彪   副主委：吴生一、王一山、严隽鸿
委  员：陆德源、蒋鹤鸣、钱  琦、朱继业、常荣庆、蔡敬仁、王罗得

九三学社上海第二医科大学第二届委员会（1993年） 
（下设院本部支社、瑞金支社、仁济支社、新华支社、九院支社）
主  委：陈仁彪   副主委：李定国、严隽鸿、吴生一
委  员：陆德源、钱  琦、蔡敬仁、顾小平、金  烨

九三学社上海第二医科大学第三届委员会（1996年）
（下设院本部支社、瑞金支社、仁济支社、新华支社、九院支社）
主  委：李定国   副主委：陈绍行、张纪蔚
委  员：倪  诚、顾国耀、陈敏怡、顾鸣敏、凌建煜、徐惠芬

九三学社上海第二医科大学第四届委员会（2001年）   115人
（下设院本部支社、瑞金支社、仁济支社、新华支社、九院支社）
主  委：李定国   副主委：陈绍行、张纪蔚
委  员：顾鸣敏、凌建煜、李培勇、倪  诚、陈敏怡、董云霓

九三学社上海交通大学医学院第五届委员会（2006年）   183人
（下设院本部支社、瑞金支社、仁济支社、新华支社、九院支社、儿中心支社）
主  委：陈绍行   副主委：李青峰、陈敏怡、顾鸣敏、张纪蔚
委  员：林建华、谢  青、李培勇、董云霓