张健教授,上海交通大学药物化学与生物信息学中心主任,兼任宁夏医科大学药学院院长,六盘山区域药用资源保护与开发利用教育部重点实验室主任,国务院学位委员会学科评议组委员,英国皇家化学会会士(FRSC),国家杰出青年基金、国家万人计划、长江学者奖励计划青年学者获得者,国家重点研发计划首席科学家。张健教授主要从事药物设计、药物化学和化学生物学研究,特别是精准靶标识别和First-in-class原创药物先导发现等方向做出了一系列突破性成果。以通讯作者在包括Nat Chem Biol, Chem等国际学术杂志上发表SCI论文140余篇。近年来代表性工作包括:(1)发展临床样本靶标识别方法识别抗肿瘤新靶标;(2)发展变构药物设计方法发现多种全新变构活性分子;(3)研发抗肿瘤新靶标首个First-in-class药物先导,如SIRT6激动剂MDL-800、APC/Asef互作抑制剂MAIT-203等,其中12篇ESI Top1%高引论文,4篇Faculty of 1000推荐,引用超1.3万次,H因子为65。第一发明人授权国内外专利10项(已转让6项)。
受邀以通讯作者在国际顶尖综述杂志Chem Rev、Chem Soc Rev撰写变构药物机制综述,均作为封面文章重点推荐;受美国化学会旗舰期刊Acc Chem Res特邀回顾申请人10年来引领变构药物设计领域发展的贡献;受Springer-Nature邀请作为主编撰写国际首本变构药物发现专著Protein Allostery in Drug Discovery并参编9本国内外医药专著;现任RSC Med Chem等3种期刊(副)主编及Med Res Rev等5种期刊编委,常年担任Science、Cell等160余种SCI期刊审稿人,欧盟ERC、英国RSC、澳大利亚FWF等10余个国家基金、奖项和Tenure考核国际评审人,先后获美国化学会Excellent Research Advisor、教育部自然科学一等奖(1/4)、吴阶平-保罗杨森医学药学奖、中国药学会生物医药创新奖、2017年中国十大科技新锐人物、Roche Creative Chemistry Award和药明康德生命化学研究奖等荣誉,连续入选斯坦福大学“全球2%顶尖科学家”终身科学影响力榜单。
教学工作中作为指导教师带领大学生获挑战杯全国总决赛特等奖、教育部拔尖学生培养计划特等奖等全国最高奖6项,获Chun-Tsung基金卓越贡献导师奖,上海交通大学优异学士指导教师,上海交通大学优秀博士论文指导教师,上海交通大学教学特等奖。主持国家重点研发计划、重大新药创制、国家自然基金委重大研究计划,重点项目,教育部新世纪人才,上海高校重点创新团队、宁夏自治区创新团队等项目,任国家自然科学基金委多类人才项目、国家重大人才工程等会评专家、国家卫健委卫生健康高级人才外聘专家、中国化学会、中国药学会、中华医学会、中国生物信息学等国家行业协会专委会常委及理事。
工作及教育经历:
1997-2002年,北京大学药学院,中国,理学学士
2002-2007年,中国科学院上海药物研究所,中国,博士学位
2007-2009年,美国密歇根大学,研究助理
2009年至今,上海交通大学医学院,杰出教授
2012年至今,上海交通大学医学院药物化学与生物信息学中心,主任
2019-2022年,上海交通大学-耶鲁大学生物统计与数据科学联合中心,主要研究员
2020年至今,宁夏医科大学药学院,院长
2023年至今,香港城市大学生物医学科学系,兼职教授
2024年至今,上海交通大学医学院临床药学院,副院长
2024年至今,六盘山区域药用资源保护、开发与利用教育部重点实验室,主任
科研项目:
进行中的项目:(列出来源、标题、金额、期限)
国家重点研发计划(2023YFF1205100),疾病靶点和变构药物设计平台的智能识别与应用开发,1700万元,2023/11/01-2026/10/30。
国家自然科学基金(22237005),结直肠癌迁移中APC/Asef相互作用的研究及其小分子抑制剂的发现,280万元,2023/01/01-2027/12/31。
宁夏科技厅重大研究计划(2022CMG01002),阻断结直肠癌迁移的APC-Asef抑制剂的开发,310万元,2022/06/01-2024/05/31。
浙江大学上海高等研究院星夜科学基金(SN-ZJU-SIAS-007),结直肠癌转移抑制剂APC-Asef的设计和优化,1500万元,2022/01/01-2024/12/31。
上海高水平地方高校创新团队(SHSMU-ZDCX20212700),新靶点的鉴定与药物候选物的发现,1280万元,2021/01/01-2023/12/31。
上海医药集团股份有限公司-科学转化医学,400万元,2021/01/01-2023/12/31。
国家自然科学基金(81925034),药物设计与先导发现,400万元,2020/01/01-2024/12/31。
国家自然科学基金(81721004),压力与癌症,180万元,2018/01/01-2023/12/31。
已完成的项目:(列出来源、标题、金额、期限)
国家自然科学基金(91753117),SIRT6去乙酰化激活剂的设计及其在人肝细胞癌中的应用,70万元,2018/01/01-2020/12/31。
国家“万人计划”青年拔尖人才(W02070065),药物设计,190万元,2016/01/01-2018/12/31。
国家重点基础研究发展计划(973计划)(2015CB910403),蛋白质翻译后修饰过程中生物标志物和潜在靶标的发现,50万元,2015/01/01-2019/12/31。
上海高等学校特聘教授(东方学者)(续聘,GZ2014008),精准药物发现,100万元,2015/01/01-2017/12/31。
国家自然科学基金(81473137),蛋白质变构位点的鉴定:方法开发与药物设计应用,65万元,2015/01/01-2018/12/31。
国家高技术研究发展计划(863计划)(2015AA020108),组学数据与知识中心的构建,65万元,2015/01/01-2017/12/31。
教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-12-0355),药物发现中的变构位点机制,50万元,2013/01/01-2017/12/31。
上海高等学校特聘教授(东方学者),精准药物发现,150万元,2011/01/01-2013/12/31。
国家“重大新药创制”科技重大专项,变构药物平台,100万元,2009/01/01-2012/12/31。
上海市教育委员会创新团队,化学生物学,50万元,2009/07/01-2012/06/30。
国家优秀博士学位论文(201083),变构STAT3抑制剂的设计,42万元,2010/10/01-2014/09/30。
上海市启明星计划(13QA1402300),药物发现中变构位点鉴定的开发,20万元,2013/07/01-2016/06/30。
上海交通大学SMG-青年学者计划。药物设计与发现,20万元,2011/01/01-2013/12/31。
上海市浦江人才计划(10PJ1406800),乳腺癌中STAT3抑制剂的优化,20万元,2010/10/01-2012/09/30。
国家自然科学基金(21002062),针对癌症的STAT3抑制剂设计与优化,19万元,2011/01/01-2013/12/31。
国家药物研究重点实验室特聘研究基金,针对癌症的药物发现,10万元,2010/04/01-2011/03/31。
论文、专利与专著:
代表性论文:
1. He J, Liu X, Zhu C, Zha J, Li Q, Zhao M, Wei J, Li M, Wu C, Wang J, Jiao Y, Ning S, Zhou J, Hong Y, Liu Y, He H, Zhang M, Chen F, Li Y, Song K, Lu X*,Zhang J*. ASD2023: towards the integrating landscapes of allosteric knowledgebase. Nucleic Acids Res. 2024, 52(D1): 376-383.
2. Zha J, He J, Wu C, Zhang M, Liu X,Zhang J*. Designing drugs and chemical probes with the dualsteric approach.Chem Soc Rev. 2023, 52: 8651-8677.
3. Zha J, Li Q, Liu X, Lin W, Wang T, Wei J, Zhang Z, Lu X, Wu J, Ni D, Song K, Zhang L, Lu X*, Lu S*,Zhang J*. AlloReverse: multiscale understanding among hierarchical allosteric regulations.Nucleic Acids Res. 2023, 51(W1): 33-38.
4. Song Q, Li M, Li Q, Lu X, Song K, Zhang Z, Wei J, Zhang L, Wei J, Ye Y, Zha J, Zhang Q, Gao Q, Long J*, Liu X*, Lu X*,Zhang J*. DeepAlloDriver: a deep learning-based strategy to predict cancer driver mutations. Nucleic Acids Res. 2023, 51(W1): 129-133.
5. Zhong J, Guo Y, Lu S, Song K, Wang Y, Feng L, Zheng Z, Zhang Q, Wei J, Sang P, Shi Y, Cai J, Chen G, Liu C*, Yang X*,Zhang J*. Rational design of a sensitivity-enhanced tracer for discovering efficient APC–Asef inhibitors.Nat Commun. 2022, 13(1): 4961.
6. Lu S*, He X, Yang Z, Chai Z, Zhou S, Wang J, Rehman AU, Ni D, Pu J, Sun J*,Zhang J*. Activation pathway of a G protein-coupled receptor uncovers conformational intermediates as novel targets for allosteric drug design.Nat Commun. 2021, 12(1): 4721(ESI Top1% highly cited paper).
7. Ni D, Wei J, He X, Rehman AU, Li X, Qiu Y, Pu J, Lu S*,Zhang J*. Discovery of cryptic allosteric sites using reversed allosteric communication by a combined computational and experimental strategy.Chem Sci. 2021, 12: 464-476(Most popular 2021 physical and theoretical chemistry articlesin Chem Sci &ESI Top1% highly cited paper).
8. Liu X, Lu S, Song K, Shen Q, Ni D, Li Q, He X, Zhang H, Wang Q, Chen Y, Li X, Wu J, Sheng C, Chen G, Lu X*,Zhang J*. Unraveling allosteric landscapes of allosterome with ASD.Nucleic Acids Res.2020,48(D1): 394-401.
9. Ni D, Li Y, Qiu Y, Lu S*,Zhang J*. Combining allosteric with orthosteric drugs to overcome drug-resistance.Trends Pharmacol Sci. 2020, 41(4): 336-348.
10. Lu S, Shen Q,Zhang J*.Allostericmethods andtheirapplications:facilitating thediscovery ofallostericdrugs and theinvestigation ofallostericmechanisms.Acc Chem Res. 2019,52(2): 492-500(ESI Top1% highly cited paper).
11. Song K, Li Q, Gao W, Lu S, Shen Q, Liu X, Wu Y, Wang B, Lin H, Chen G,Zhang J*.AlloDriver: amethod for the identification and analysis of cancer driver targets.Nucleic Acids Res.2019, 47(W1): 315-321.
12. Lu S*, Ni D, Wang C, He X, Lin H, Wang Z*,Zhang J*.Deactivationpathway of Ras GTPaseunderliesconformational substates astargets fordrugdesign.ACS Catalysis. 2019, 9(8): 7188-7196.
13. Lu S, He X, Ni D,Zhang J*.Allostericmodulatordiscovery:fromserendipity tostructure-baseddesign.J Med Chem. 2019, 62(14):6405-6421 (Recommended byFaculty of1000 four times).
14. Lu S,Zhang J*.Smallmoleculeallostericmodulators of G-Protein-Coupled Receptors:drug-targetinteractions. J Med Chem. 2019, 62(1): 24-45 (ESI Top1% highly cited paper).
15. Huang Z, Zhao J, Deng W, Chen Y, Shang J, Song K, Zhang L, Wang C, Lu S, Yang X, He B, Min J, Hu H, Tan M, Xu J, Zhang Q, Zhong J, Sun X, Mao Z, Lin H, Xiao M, Chin YE, Jiang H, Xu Y*, Chen G*,Zhang J*. Identification of a cellularly active SIRT6 allosteric activator.Nat Chem Biol. 2018, 14(12): 1118-1126 (Recommended by“Innovations” inBiocentury, 2018, November 7).
16. Huang M, Song K, Liu X, Lu S, Shen Q, Wang R, Gao J, Hong Y, Li Q, Ni D, Xu J, Chen G,Zhang J*.AlloFinder: astrategyfor allosteric modulator discovery and allosterome analyses.Nucleic Acids Res.2018, 46(W1): 451-458.
17. Yang X, Zhong J, Zhang Q, Qian J, Song K, Ruan C, Xu J, Ding K,Zhang J*.Rational design and structure validation of a novel peptide inhibitor of the adenomatous polyposis coli (APC)-rho guanine nucleotide exchange factor 4 (Asef) interaction.J Med Chem.2018,61(17): 8017-8028.
18. Jiang H, Deng R, Yang X, Shang J, Lu S, Zhao Y, Song K, Liu X, Zhang Q, Chen Y, Chinn YE, Wu G, Li J, Chen G, Yu J*,Zhang J*. Peptidomimetic inhibitors of APC-Asef interaction block colorectal cancer migration.Nat Chem Biol. 2017, 13(9): 994-1001 (Recommended by“Research Watch” inCancer Discov, 2017,August 4).
19. Shen Q, Cheng F, Song H, Lu W, Zhao J, An X, Liu M, Chen G, Zhao Z*,Zhang J*.Proteome-scale investigation of protein allosteric regulation perturbed by somatic mutations in 7,000 cancer genomes.Am J Hum Genet. 2017, 100(1): 5-20.
20. Song K, LiuX, HuangW,LuS,ShenQ, ZhangL, Zhang J*.Improvedmethod for theidentification andvalidation ofallostericsites.J Chem Inf Model. 2017,57(9): 2358-2363.
21. Lu S, Jang H, Muratcioglu S, Gursoy A, Keskin O, Nussinov R*, ZhangJ*.Rasconformationalensembles,allostery andsignaling.Chem Rev. 2016, 116(11): 6607-6665 (ESI Top1% highly cited paper).
22. Shen Q, Wang G, Li S, Liu X, Lu S, Chen Z, Song K, Yan J, Geng L, Huang Z, Huang W, Cheng G,Zhang J*.ASD v3.0: unraveling allosteric regulation with structural mechanisms and biological networks.Nucleic Acids Res.2016, 44(D1):527-535.
23. Li S, Shen Q, Su M, Liu X, Lu S, Chen Z, Wang R,Zhang J*.Alloscore: amethod for predicting allosteric ligand-protein interactions.Bioinformatics. 2016,32(10):1574-1576.
24. Huang W, Wang G, Shen Q, Liu X, Lu S, Geng L, Huang Z,Zhang J*. ASBench: benchmarking sets for allosteric discovery.Bioinformatics. 2015,31(15): 2598-2600.
25. Huang Z, Mou L, Shen Q, Lu S, Li C, Liu X, Wang G, Li S, Geng L, Liu Y, Wu J, Chen G,Zhang J*. ASD v2.0: updated content and novel features focusing on allosteric regulation.Nucleic Acids Res.2014, 42(D1): 510-516.
26. Zhao Y, Zhang X, Chen Y, Lu S, Peng Y, Wang X, Guo C, Zhou A, Zhang J, Luo Y, Shen Q, Ding J, Meng L*,Zhang J*. Crystal structures of PI3Kα complexed with PI103 and its derivatives: new directions for inhibitors design.ACS Med Chem Lett. 2014, 5(2): 138-142 (Recommended by Faculty of 1000 and ACS Medicinal Chemistry Letters ”In This Issue”).
27. Lu S, Huang W, Wang Q, Shen Q, Li S, Nussinov R*,Zhang J*. Thestructuralbasis of ATP as anallostericmodulator.PLoS Comput Biol.2014, 10(9): e1003831.
28. Huang W, Lu S, Huang Z, Liu X, Mou L, Luo Y, Zhao Y, Liu Y, Chen Z, Hou T,Zhang J*. Allosite: a method for predicting allosteric sites.Bioinformatics. 2013, 29(18): 2357-2359.
29. Huang Z, Zhu L, Cao Y, Wu G, Liu X, Chen Y, Wang Q, Shi T, Zhao Y, Wang Y, Li W, Li Y, Chen HF*, Chen G, Zhang J*. ASD: a comprehensive database of allosteric proteins and modulators. Nucleic Acids Res. 2011, 39(D1): 663-669.
30. Liu X, Su X, Wang F, Huang Z, Wang Q, Li Z, Zhang R, Wu L, Pan Y, Chen Y, Zhuang H, Chen G, Shi T, Zhang J*. ODORactor: a web server for deciphering olfactory coding. Bioinformatics. 2011, 27(16): 2302-2303.
荣誉与奖励:
2002年,北京大学优秀毕业生
2005年,上海药物研究所高义生奖
2006年,中国科学院优秀毕业生
2006年,罗氏创新化学奖
2006年,中国科学院院长杰出毕业生奖
2007年,上海市优秀博士学位论文
2008年,中国科学院优秀博士学位论文
2009年,全国优秀博士学位论文,中国
2010年,上海高等学校特聘教授(东方学者),2014年续聘
2012年,中国大学新世纪优秀人才
2013年,国家自然科学优秀青年科学基金
2014年,上海市卫生系统杰出青年奖
2015年,国家支持的顶尖青年专业人才计划
2017年,教育部长江学者和创新研究团队
2017年,药明康德2017年生命科学与化学奖
2018年,中国药学会生物医学创新奖
2018年,美国化学会优秀研究指导教师
2019年,国家自然科学杰出青年科学基金
2021年,上海交通大学千春特聘教授
2022年,皇家化学学会会士(FRSC)
2022年,美国化学会优秀研究指导教师
2022年,教育部自然科学奖一等奖
2022-2023年,斯坦福大学发布的全球TOP2%科学家(职业生涯长期及单年)
2023年,春藤基金杰出贡献奖-优秀导师
2024年,吴阶平-保罗·詹森医学药学奖