“十五”“211工程”期间学校在教室、临床实习基地，校园网，图书馆和实验动物部方面都取得了明显的建设成效。
　　（一）教学改革迈出新步，办学层次得以提升
　　“十五”“211工程”建设期间，学校在保持临床医学、口腔医学等专业传统优势的基础上，加快了医学教育改革与创新的步伐。
　　根据医学相关专业的专业特征和临床实际需求，在国内较早试行了护理学和医学检验学专业的“五改四”学制及授予理学士的改革，并基本建立和完善了与之相适应的培养计划、课程体系、教学内容。在广泛深入研究的基础上，借鉴发达国家医学教育的成功经验，在国内率先举办了“4+4”八年制临床医学硕-博连读专业，并取得了可喜成效；2005年起又启动了八年一贯制临床医学专业人才培养模式。根据社会对不同卫生人才的实际需求，适时开办了药学、营养学及医药营销等三个新的本科专业。“十五”期间，研究生教育快速发展，现有一级学科博士点5个，二级学科博士点31个，二级学科硕士点47个；博士生导师348名，硕士生导师644名，在校研究生2154名，其中硕士生1384名，博士生770名，办学质量稳步提高。中外合作办学渠道更加宽广，合作模式更趋多样，留学生规模明显扩大。在中法合作办学这一传统特色不断取得新进展的同时，与美国、澳大利亚、芬兰、日本和瑞典等国医学院校的合作与交流也取得了新突破。
　　经过“十五”“211工程”建设，学校专业布局更趋合理，教育国际化程度迈上新台阶。在2003年教育部组织的七年制高等医学教育教学评估和本科教学工作水平评估中取得了优秀成绩。
　　随着医学科学发展、医学模式转化及医疗卫生事业改革的不断深入，我校在医学教育上也遇到了更多的问题和挑战。在“十五”“211工程”的支持下，我校开展了一系列的教育改革和机制探索，在培养目标和培养模式、专业结构和学科体系、课程体系和教学内容、教学方法以及教学管理等诸方面进行了深化改革，以适应国际化大都市发展的需要，努力达到国际一流医科大学的水平。

—— 专业布局更加合理
　　我校结合目前国际医药发展趋势，借鉴国外办学经验，新增了三个专业，三个学院。众多专业从无到有，从有到优，使我校的专业布局更为合理，培养了一大批高起点、社会急需的复合型人才。

—— 课程设置更符合国际惯例
　　我国的经济在快速发展，医学卫生教育也在高速发展，需要大批基础宽、专业强的各种类型的人才。与临床医师不同，检验专业的人才虽然需求不大，但检验专业的历史地位和中国特点决定了需要大量高素质的检验专业本科人才去充实和加强原有学科的结构，以适应实验诊断或检验医学的快速发展。另一方面，除医院、科研机构外，还有大量企业（试剂、制药、仪器、设备等）都需要检验专业的技术型毕业生。所以我校率先在全国提出了新的培养模式：①四年学制本科理学士学位，培养高级检验技师。②七年制临床病理学专家。使我校的毕业生具有较扎实的专业基础知识，较高的管理水平，较好的计算应用能力和科学研究能力，逐渐成为上海地区检验医学的中坚力量。

—— 教学实践更加丰富
　　在“十五”“211工程”建设期间，我校建设的六个实训中心在实际教学中发挥了巨大的作用。实验教学的模拟仿真性高，操作锻炼性强，浓厚了学生们对实验学习的兴趣，增强了学习主动性，学习收获更大。同时交互式教学，使教学目的更加突出，效果更加明显，同时对教师的带教水平提出了更高的要求，对教师也是一个很大的促进。学生的实际操作能力显著提高，自信心增加，为他们的实习和毕业后临床工作打下了坚实的基础。学生的基础操作技能得到强化训练，我校各专业毕业生成为上海市各大医院认可的首选学生之一。

—— 教学软、硬件更加完善
　　作为一所有着悠久历史的医学院，我们在“十五”“211工程”的支持下，大力改造和新建了一批教室、实验室，配备了教学急需的设施装备，使学校的办学条件面貌一新，为提高教学质量提供了硬件保证。如通过数码互动教室解决了多媒体课件内各疾病图像往往只有单一静止画面的不足，更有助于授课教师和学生的沟通，丰富了实验教学的手段。学生在实验过程中遇到问题可随时通过语音问答系统和图象系统将问题反馈给教师，并能得到及时的解答。同时，本教研室也充分利用多媒体演示系统资源，加强对平时实验课内容的考查，改进实验考试的方式，真正了解了学生实际掌握知识的情况
　　同时，各个教研室抓住有利时机，鼓励和支持教师们编写优秀教材，改革教学方式方法，多个教材获得国家和上海市的优秀教材奖，共有四个课程获得国家和市级精品课程称号。

（二）校园设施显著改善，文明建设再上台阶
　　“十五”“211工程”期间，学校抓住契机，努力拓展筹资渠道，多方争取建设专项，加大了教学、科研设施以及校园的改造、建设力度，新建并启用了东院科教综合楼、合肥路学生公寓，全面改造了信息资源中心大楼、体育馆等设施，大大改善了师生的学习、工作和生活条件。临床模拟人等实训基地的建设，进一步增加了学生的实践机会。通过校园网二期、三期项目建设，形成了以2.5G RPR弹性分组环技术为主干环路的网络高速公路，为全面建成数字化校园奠定了基础。此外，还对校园重新进行了规划和布局，西院教学中心楼已被批准立项，占地300多亩的南汇新校区建设即将竣工。
　　同时，精神文明建设取得了重大进展，进入了常态、长效管理的轨道，原上海第二医科大学已连续十四年获得上海市文明单位，实现了“七连冠”，并和各附属医院连续两届获得上海市文明单位，实现了“满堂红”。尤其是2005年，原上海第二医科大学、附属瑞金医院还首次获得全国文明单位的称号，精神文明建设上了一个新台阶。

—— 档案建设更科学合理
　　医学院档案馆建馆于1989年6月，通过“十五”“211工程”建设，档案馆总建筑面积达1317m2，库房建筑面积1143m2，至2005年12月馆藏档案案卷总数为59015卷，照片档案20128张，光盘33盘。1952年建校以后形成馆藏档案有14个全宗，内容涉及学校党群、行政、教学、科研、基建、设备、出版、外事、财会、产品、名人、声像等门类档案。形成了多种不同载体、多门类的具有历史保存价值的珍贵资料体系，档案真实记载了学校发展的历史轨迹，在学校各个不同时期的发展中发挥了积极的作用。档案管理。

—— 信息资源建设绩效
　　[校园网建设的成效] 校园网建设子项目的完成，标志了学院信息基础设施已初步建设完成。对配合学校教学评优，培养学生运用信息技术的素养，改善校园网应用环境，提高学校现代化教育和管理技术水平方面起到了十分显著的作用。
　1.为全院师生员工改善和拓展了数字化、信息化资源的应用条件。
　2.为学院远程教育学院的远程教学工作的开展创造了条件。
　3.为学院重点学科和E-研究院建设提供了优良的网络应用条件。
　4.为学院数字化校园建设和应用提供了良好网络应用基础环境。
　5.为学院增进国内外交流与合作提供了良好的互联网应用环境。
　6.为上海市及其周边地区高教系统校园网建设和应用起到了较好的示范作用。

[图书馆建设成效]
　1.初步建成数字图书馆网络平台。在环境设施、特色建设、信息化建设、信息服务等诸多方面已处于全国医学院校图书馆的前列，并已初步建成自数据收集、加工到管理、信息发布的一体化数字作业平台；
　2.初步建立"上海交通大学医学院系统"范围的文献信息资源保障平台。目前已通过采用读者远程认证、双网络VPN方式建立起了覆盖整个医学院及附属单位的文献资源服务与保障平台，同时，世界卫生组织信息资源（WHO）中心也基本建成；
　3.先后完成了教学用医学图像档案存储与管理系统（E-PACS）、二医精品课程(57门)、E-研究院统一信息资源平台、心理咨询网、虚拟参考咨询系统（VRD）、多媒体视频点播系统（VOD）、多媒体文档管理系统等一批具有我校自主知识产权的新成果。
　4.率先引进一批高质量的专业电子资源（OVID、MICROMEDEX）。据上海高校图工委统计2003年本馆单篇信息服务量名列上海高校首位。
　5.形成信息资源中心运行新模式；
　6.培养出一支信息化建设复合型队伍。

—— 实验动物科学部建设成效
　　通过“十五”“211工程”建设，实验动物科学部对实验动物设施和动物实验的管理水平有所提高，达到了国内先进水平。设施的多样化和先进性，得到了国内外专家的首肯。成为上海地区唯一能进行牛外科实验的实验动物科学部，也是上海第一所能科学化、标准化开展实验猕猴动物实验的高等院校；动科部管理机制的良性运行也受到国内众多实验动物生产与使用单位的推崇和借鉴。由于校区位于都市，交通十分方便，通过挖掘潜力，统筹安排，动科部在完成校本部和附属医院动物实验任务的同时，还为其它兄弟单位到二医的实验动物科学部进行动物实验提供了方便。